RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491274.5

SDHB-208, Transcript of succinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit B, humanhuman

TSL 5

Gene SDHB, Length 649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHB-208ENST00000491274 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 OR10T2Q8NGX3 314 aa7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 ITFG1Q8TB96 612 aa7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 PARD3BQ8TEW8 1205 aa7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 ING5Q8WYH8 240 aa7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 EDAQ92838 391 aa7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 MCRS1Q96EZ8 462 aa7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 EEF2KMTQ96G04 330 aa7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 BORCS6Q96GS4 357 aa7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 GBP4Q96PP9 640 aa7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 CITED4Q96RK1 184 aa7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 TMEM209Q96SK2 561 aa7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 ACBD6Q9BR61 282 aa7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 ASAH2Q9NR71 780 aa7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 MAN1B1Q9UKM7 699 aa7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 GTF3C4Q9UKN8 822 aa7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 CDH7Q9ULB5 785 aa7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 L1RE1Q9UN81 338 aa7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 YIPF1Q9Y548 306 aa7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 UNC80Q8N2C7 3258 aa7.13□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 MTMR11A4FU01 709 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 A8MXQ7 604 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 SOAT2O75908 522 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 AKAP3O75969 853 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 PIK3CAP42336 1068 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 GCLMP48507 274 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 DLG4P78352 724 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 ZXDAP98168 799 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 TDGQ13569 410 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 NFIL3Q16649 462 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 SOWAHAQ2M3V2 549 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 EDRF1Q3B7T1 1238 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 ZNF667Q5HYK9 610 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 ANKRD40Q6AI12 368 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 SV2AQ7L0J3 742 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 ITIH5Q86UX2 942 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 LRRTM3Q86VH5 581 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 CREBRFQ8IUR6 639 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 SCN4BQ8IWT1 228 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 UBALD2Q8IYN6 164 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 LEMD2Q8NC56 503 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 SPPL2BQ8TCT7 592 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 TMEM174Q8WUU8 243 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 FGF13Q92913 245 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 NXPE3Q969Y0 559 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 GCNAQ96QF7 691 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 MYADMQ96S97 322 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 PI4K2AQ9BTU6 479 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 IMPG2Q9BZV3 1241 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 DNAI2Q9GZS0 605 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 KCNK12Q9HB15 430 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.279e-12■■■■■ 149.1
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SDHB-208ENST00000491274 IGSF9Q9P2J2 1179 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 FBXL21Q9UKT6 434 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 CDH9Q9ULB4 789 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 SORCS3Q9UPU3 1222 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 ASB3Q9Y575 518 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 BRWD1Q9NSI6 2320 aa7.12□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 BICDL2A1A5D9 508 aa7.11□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 TMEM221A6NGB7 291 aa7.11□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 M0R296 226 aa7.11□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 MAPK13O15264 365 aa7.11□□□□□ -1.27
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SDHB-208ENST00000491274 IL2RAP01589 272 aa7.11□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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SDHB-208ENST00000491274 FAM163BP0C2L3 166 aa7.11□□□□□ -1.27
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SDHB-208ENST00000491274 TRIM49CP0CI26 452 aa7.11□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 CCNE1P24864 410 aa7.11□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 LMO2P25791 158 aa7.11□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 CYP27A1Q02318 531 aa7.11□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 LRRC63Q05C16 580 aa7.11□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 DDR2Q16832 855 aa7.11□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 ZACNQ401N2 412 aa7.11□□□□□ -1.27
SDHB-208ENST00000491274 CCDC40Q4G0X9 1142 aa7.11□□□□□ -1.27
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