RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa18.26■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa18.26■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 VCPIP1Q96JH7 1222 aa18.26■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF560Q96MR9 790 aa18.26■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 CPXM1Q96SM3 734 aa18.26■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 A8MXQ7 604 aa18.25■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 SART1O43290 800 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 FAM107AO95990 144 aa18.25■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 CCL5P13501 91 aa18.25■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 CNGA2Q16280 664 aa18.25■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa18.25■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 CABS1Q96KC9 395 aa18.25■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 TSPAN16Q9UKR8 245 aa18.25■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 GIT1Q9Y2X7 761 aa18.25■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 GOLGA8SH3BPF8 625 aa18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 MYZAPP0CAP1 466 aa18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 LRPAP1P30533 357 aa18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 NCAPGQ9BPX3 1015 aa18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 AP1M1Q9BXS5 423 aa18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 LHX5Q9H2C1 402 aa18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 RSAD1Q9HA92 442 aa18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 DNM1LO00429 736 aa18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 KRIT1O00522 736 aa18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF623O75123 536 aa18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 CDK7P50613 346 aa18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 LLGL1Q15334 1064 aa18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 SV2CQ496J9 727 aa18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 C3orf58Q8NDZ4 430 aa18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 APPL2Q8NEU8 664 aa18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 OR2W6PQ8NHA6 318 aa18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 PARVAQ9NVD7 372 aa18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 GDAP2Q9NXN4 497 aa18.24■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 H0YGN5 161 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 HUS1O60921 280 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 CALB1P05937 261 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 PNPLA4P41247 253 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 GPD2P43304 727 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 CCDC142Q17RM4 750 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 CCDC91Q7Z6B0 441 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 ECHDC2Q86YB7 292 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 CCDC26Q8TAB7 109 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 FEZF2Q8TBJ5 459 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 CD101Q93033 1021 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 MCEEQ96PE7 176 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 TSPAN18Q96SJ8 248 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 WBP1LQ9NX94 342 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 NFS1Q9Y697 457 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 CYB561D2O14569 222 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 FAM126BQ8IXS8 530 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 NEUROG2Q9H2A3 272 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 SYNCQ9H7C4 482 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 SLC38A7Q9NVC3 462 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 GGA2Q9UJY4 613 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 USTQ9Y2C2 406 aa18.23■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 PODXLO00592 558 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 ERBB2P04626 1255 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 PFKMP08237 780 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 RGS7P49802 495 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 PEX5P50542 639 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 RAB27AP51159 221 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 IFT88Q13099 833 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 WSCD1Q658N2 575 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 DNAJC24Q6P3W2 148 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 OSTM1Q86WC4 334 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 ADGRF2Q8IZF7 708 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 RASGEF1CQ8N431 466 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 LINC01599Q8WXQ3 324 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 SNX25Q9H3E2 840 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 ATP2C2O75185 946 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 CCDC130P13994 396 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF844Q08AG5 666 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 MTMR3Q13615 1198 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 LCLAT1Q6UWP7 414 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 LRRC8DQ7L1W4 858 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 TTC39CQ8N584 583 aa18.22■□□□□ 0.51
PRRT4-205ENST00000489835 UBL4BQ8N7F7 174 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms