RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	NKD1	Q969G9	470 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM143	Q96AN5	459 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SPATA33	Q96N06	139 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PTPN18	Q99952	460 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TLR10	Q9BXR5	811 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ISCU	Q9H1K1	167 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	FZD8	Q9H461	694 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB20	Q9NX57	234 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC151	A5D8V7	595 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKRD62	A6NC57	917 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247		K7ERI5	159 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ACKR2	O00590	384 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MAGEB2	O15479	319 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PPFIA4	O75335	1185 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MOCS3	O95396	460 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	C22orf31	O95567	290 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	LGALS2	P05162	132 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	EDN1	P05305	212 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	NTF4	P34130	210 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MFAP3	P55082	362 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PTEN	P60484	403 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SP4	Q02446	784 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	BRD3	Q15059	726 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SURF1	Q15526	300 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	WDR93	Q6P2C0	686 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	GJB7	Q6PEY0	223 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PAOX	Q6QHF9	649 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR142	Q7Z601	462 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF677	Q86XU0	584 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	FBXL6	Q8N531	539 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	UBR7	Q8N806	425 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	RFFL	Q8WZ73	363 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	USP6NL	Q92738	828 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SEMA4D	Q92854	862 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	GATA6	Q92908	595 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MAML3	Q96JK9	1138 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	NT5C1B	Q96P26	610 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CGRRF1	Q99675	332 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	AGPAT1	Q99943	283 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PIDD1	Q9HB75	910 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TFR2	Q9UP52	801 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SI	P14410	1827 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ARID2	Q68CP9	1835 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	OGT	O15294	1046 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	B4GALT4	O60513	344 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CILP	O75339	1184 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CLSTN1	O94985	981 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TGFB1	P01137	390 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	F13B	P05160	661 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CHRNB2	P17787	502 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF132	P52740	706 aa		5.94	□□□□□ -1.46

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