RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 BPIFB1Q8TDL5 484 aa5.94□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 POF1BQ8WVV4 589 aa5.94□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 CRB3Q9BUF7 120 aa5.94□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 MAGEB5Q9BZ81 275 aa5.94□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 FAM83DQ9H4H8 585 aa5.94□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 CAPN11Q9UMQ6 739 aa5.94□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa5.94□□□□□ -1.46
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CCL20-204ENST00000489160 IDEP14735 1019 aa5.92□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 GATA3P23771 443 aa5.92□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 TRAPPC10P48553 1259 aa5.92□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 COPAP53621 1224 aa5.92□□□□□ -1.46
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CCL20-204ENST00000489160 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.92□□□□□ -1.46
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CCL20-204ENST00000489160 ICE2Q659A1 982 aa5.92□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 PGBD2Q6P3X8 592 aa5.92□□□□□ -1.46
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CCL20-204ENST00000489160 SPRED1Q7Z699 444 aa5.92□□□□□ -1.46
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CCL20-204ENST00000489160 SLC15A3Q8IY34 581 aa5.92□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 FAM109AQ8N4B1 249 aa5.92□□□□□ -1.46
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CCL20-204ENST00000489160 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa5.91□□□□□ -1.46
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CCL20-204ENST00000489160 TP53BP2Q13625 1128 aa5.91□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 TUBA3CQ13748 450 aa5.91□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP5.91□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 ZNF750Q32MQ0 723 aa5.91□□□□□ -1.46
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CCL20-204ENST00000489160 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
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CCL20-204ENST00000489160 TUBA3EQ6PEY2 450 aa5.91□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa5.91□□□□□ -1.46
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CCL20-204ENST00000489160 PODXLO00592 558 aa5.9□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 MATN3O15232 486 aa5.9□□□□□ -1.46
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CCL20-204ENST00000489160 RGS10O43665 173 aa5.9□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 LPXNO60711 386 aa5.9□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 PIAS2O75928 621 aa5.9□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 SRGNP10124 158 aa5.9□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 GABRB3P28472 473 aa5.9□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 ICA1Q05084 483 aa5.9□□□□□ -1.46
CCL20-204ENST00000489160 SCAPQ12770 1279 aa5.9□□□□□ -1.46
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