RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487591.5

RRM2-208, Transcript of ribonucleotide reductase regulatory subunit M2, human

TSL 2

Gene RRM2, Length 592 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM2-208	ENST00000487591	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		9.38	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	CYB561D2	O14569	222 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	ADAM23	O75077	832 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	ODC1	P11926	461 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	PLS3	P13797	630 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	CYP2F1	P24903	491 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	GUCY2C	P25092	1073 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	BFSP1	Q12934	665 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	PDGFRL	Q15198	375 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	PTPA	Q15257	358 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	CRY1	Q16526	586 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	FBXO43	Q4G163	708 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	OSTM1	Q86WC4	334 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	TTC30A	Q86WT1	665 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	ALLC	Q8N6M5	410 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	FIZ1	Q96SL8	496 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	CD93	Q9NPY3	652 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591		A0A0B4J269	797 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	OGT	O15294	1046 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	NOL4	O94818	638 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	ACOT2	P49753	483 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	SLC12A3	P55017	1021 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	NCKAP1L	P55160	1127 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	PDIA5	Q14554	519 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	VEPH1	Q14D04	833 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	CPA6	Q8N4T0	437 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	MDM1	Q8TC05	714 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	ACD	Q96AP0	544 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	DRC1	Q96MC2	740 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	CAPN10	Q9HC96	672 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	DNM3	Q9UQ16	869 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	MAST4	O15021	2626 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	TNFRSF10B	O14763	440 aa		9.35	□□□□□ -0.91
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RRM2-208	ENST00000487591	GJB3	O75712	270 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	PIGR	P01833	764 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	PRB1	P04280	392 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	CYP17A1	P05093	508 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	9.35	□□□□□ -0.91
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RRM2-208	ENST00000487591	USP46	P62068	366 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	STRN3	Q13033	797 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	MIB1	Q86YT6	1006 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	SYT12	Q8IV01	421 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	CXorf38	Q8TB03	319 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
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RRM2-208	ENST00000487591	GCNA	Q96QF7	691 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	RNF38	Q9H0F5	515 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
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RRM2-208	ENST00000487591	L1RE1	Q9UN81	338 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	KNTC1	P50748	2209 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	TRIM24	O15164	1050 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	SH3BP5	O60239	455 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	ATP2C2	O75185	946 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	CFI	P05156	583 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	CKM	P06732	381 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	CSH1	P0DML2	217 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RRM2-208	ENST00000487591	CSH2	P0DML3	217 aa		9.34	□□□□□ -0.91

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