RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487269.1

FAM204A-208, Transcript of family with sequence similarity 204 member A, human

TSL 2

Gene FAM204A, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM204A-208	ENST00000487269	EGF	P01133	1207 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	TNNC2	P02585	160 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	BDNF	P23560	247 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	PCSK1	P29120	753 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	LHX1	P48742	406 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	CACNA2D1	P54289	1103 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	NRL	P54845	237 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	IQUB	Q8NA54	791 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	MYRFL	Q96LU7	910 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	GCNT4	Q9P109	453 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	ANTXRL	A6NF34	631 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	AFM	P43652	599 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	CASP4	P49662	377 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	ZXDB	P98169	803 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	CYP24A1	Q07973	514 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	MYO1E	Q12965	1108 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	CUL4B	Q13620	913 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	PPP2R5D	Q14738	602 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	MTF1	Q14872	753 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF77	Q15935	545 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	WDR49	Q8IV35	697 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	SPATA18	Q8TC71	538 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	SNX21	Q969T3	373 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	MMS19	Q96T76	1030 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	CGRRF1	Q99675	332 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	CUEDC2	Q9H467	287 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	CDH9	Q9ULB4	789 aa		12.74	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	RNF40	O75150	1001 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	F13A1	P00488	732 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	CKM	P06732	381 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	TNNI1	P19237	187 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	GJA4	P35212	333 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	MAGEA11	P43364	429 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	GALK1	P51570	392 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	MYL6	P60660	151 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	AMPD3	Q01432	767 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	CYP27A1	Q02318	531 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	USP4	Q13107	963 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	PSMD6	Q15008	389 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	SURF1	Q15526	300 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	UNC13D	Q70J99	1090 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	DPH6	Q7L8W6	267 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	LONP2	Q86WA8	852 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	PCED1B	Q96HM7	432 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	ECT2	Q9H8V3	914 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	RAB23	Q9ULC3	237 aa		12.73	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		12.72	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		12.72	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269		F8VP50	259 aa		12.72	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	CLDN5	O00501	218 aa		12.72	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	RET	P07949	1114 aa		12.72	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	USP17L7	P0C7H9	530 aa		12.72	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	GRIK1	P39086	918 aa		12.72	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	ME1	P48163	572 aa		12.72	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		12.72	□□□□□ -0.37
FAM204A-208	ENST00000487269	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	12.72	□□□□□ -0.37

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