RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 ACAD10Q6JQN1 1059 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 MFSD5Q6N075 450 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 DNAAF5Q86Y56 855 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 LRRC52Q8N7C0 313 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 OR2W6PQ8NHA6 318 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 SLCO2A1Q92959 643 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 TRIM11Q96F44 468 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 KIF12Q96FN5 646 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 HPDLQ96IR7 371 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 TRIM51Q9BSJ1 452 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 IMPG2Q9BZV3 1241 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 THAP2Q9H0W7 228 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 SDCBP2Q9H190 292 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 HOMER3Q9NSC5 361 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 FAM105AQ9NUU6 356 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 SAMD15Q9P1V8 674 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 GTF3C4Q9UKN8 822 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 POLIQ9UNA4 740 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 AGAP1Q9UPQ3 857 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 BRCA2P51587 3418 aa10.14□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 A0A0U1RQF3 1178 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 CFAP73A6NFT4 308 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 PTGESO14684 152 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 INPPL1O15357 1258 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 RASSF9O75901 435 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 CALCAP01258 141 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 CYP1A2P05177 515 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 CTSHP09668 335 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 WEE2P0C1S8 567 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 FAM163BP0C2L3 166 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 CKBP12277 381 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 RARGP13631 454 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 KRT5P13647 590 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 DRD4P21917 467 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 LRPAP1P30533 357 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 SLC8A1P32418 973 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 PDE6CP51160 858 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 INCA1Q0VD86 236 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 MBTPS1Q14703 1052 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 GPNMBQ14956 572 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 SNCBQ16143 134 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 WDR72Q3MJ13 1102 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF667Q5HYK9 610 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 C9orf57Q5W0N0 161 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM270Q6UE05 265 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 GRK7Q8WTQ7 553 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF606Q8WXB4 792 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 ARHGEF26Q96DR7 871 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 SGSM3Q96HU1 749 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 NCAPGQ9BPX3 1015 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 STARD7Q9NQZ5 370 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 KLC4Q9NSK0 619 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 ALG6Q9Y672 507 aa10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 KBTBD13C9JR72 458 aa10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 NDC80O14777 642 aa10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 PPEF2O14830 753 aa10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 SPOPO43791 374 aa10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 CILPO75339 1184 aa10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 ECEL1O95672 775 aa10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 CFHP08603 1231 aa10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 KRT19P08727 400 aa10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 MYBL1P10243 752 aa10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 CCL5P13501 91 aa10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 CD52P31358 61 aa10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 PTGIRP43119 386 aa10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 RAD23BP54727 409 aa10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 PLTPP55058 493 aa10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 RWDD2BP57060 319 aa10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 LMNB2Q03252 620 aa10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 ZDHHC24Q6UX98 284 aa10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 TRIM72Q6ZMU5 477 aa10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 AGMOQ6ZNB7 445 aa10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 FAM126BQ8IXS8 530 aa10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 BBOF1Q8ND07 529 aa10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 BEST2Q8NFU1 509 aa10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 TFAP2BQ92481 460 aa10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 SELENOSQ9BQE4 189 aa10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
POLR1A-208ENST00000486964 SLC40A1Q9NP59 571 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms