RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 SCAND1P57086 179 aa3.85□□□□□ -1.79
CACNA2D1-211ENST00000486539 TREML2Q5T2D2 321 aa3.85□□□□□ -1.79
CACNA2D1-211ENST00000486539 TAF2Q6P1X5 1199 aa3.85□□□□□ -1.79
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC30A10Q6XR72 485 aa3.85□□□□□ -1.79
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
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CACNA2D1-211ENST00000486539 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa3.85□□□□□ -1.79
CACNA2D1-211ENST00000486539 MED30Q96HR3 178 aa3.85□□□□□ -1.79
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CACNA2D1-211ENST00000486539 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
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CACNA2D1-211ENST00000486539 TCF15Q12870 199 aa3.83□□□□□ -1.8
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CACNA2D1-211ENST00000486539 C4orf46Q504U0 113 aa3.83□□□□□ -1.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 VPS53Q5VIR6 699 aa3.83□□□□□ -1.8
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CACNA2D1-211ENST00000486539 RNF180Q86T96 592 aa3.83□□□□□ -1.8
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CACNA2D1-211ENST00000486539 SIK2Q9H0K1 926 aa3.83□□□□□ -1.8
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CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
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CACNA2D1-211ENST00000486539 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
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CACNA2D1-211ENST00000486539 C14orf119Q9NWQ9 140 aa3.81□□□□□ -1.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 RAD54BQ9Y620 910 aa3.81□□□□□ -1.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa3.8□□□□□ -1.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 LDB3O75112 727 aa3.8□□□□□ -1.8
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CACNA2D1-211ENST00000486539 AGXTP21549 392 aa3.8□□□□□ -1.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 CYP2C19P33261 490 aa3.8□□□□□ -1.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 KCNJ4P48050 445 aa3.8□□□□□ -1.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 TPTEP56180 551 aa3.8□□□□□ -1.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 MTX1Q13505 466 aa3.8□□□□□ -1.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC93Q567U6 631 aa3.8□□□□□ -1.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 GADL1Q6ZQY3 521 aa3.8□□□□□ -1.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q6ZWC4 215 aa3.8□□□□□ -1.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 RAB24Q969Q5 203 aa3.8□□□□□ -1.8
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CACNA2D1-211ENST00000486539 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
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CACNA2D1-211ENST00000486539 VTA1Q9NP79 307 aa3.8□□□□□ -1.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 CFAP97Q9P2B7 532 aa3.8□□□□□ -1.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPTLC2O15270 562 aa3.79□□□□□ -1.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDC45O75419 566 aa3.79□□□□□ -1.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRTAP5-8O75690 187 aa3.79□□□□□ -1.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 SYF2O95926 243 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CACNA2D1-211ENST00000486539 UMODP07911 640 aa3.79□□□□□ -1.8
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