RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486388.5

UBP1-210, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 3

Gene UBP1, Length 928 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-210	ENST00000486388	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		5.21	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	USP18	Q9UMW8	372 aa		5.21	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	NID2	Q14112	1375 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	MAN2B1	O00754	1011 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF197	O14709	1029 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	TMPRSS2	O15393	492 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	TSPAN1	O60635	241 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	TDP2	O95551	362 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	TH	P07101	528 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	RPS6KB1	P23443	525 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	AKAP5	P24588	427 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	NPEPPS	P55786	919 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	GPC5	P78333	572 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	CYP4A11	Q02928	519 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	ADCY1	Q08828	1119 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	EPHA7	Q15375	998 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	PSMD5	Q16401	504 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	INF2	Q27J81	1249 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	PARM1	Q6UWI2	310 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	NEK8	Q86SG6	692 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	ELMOD1	Q8N336	334 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	FBXL16	Q8N461	479 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	WASF1	Q92558	559 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	FGF13	Q92913	245 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	CRELD1	Q96HD1	420 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	CPB2	Q96IY4	423 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	CEP89	Q96ST8	783 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	RTKN	Q9BST9	563 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	IER2	Q9BTL4	223 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	FOXQ1	Q9C009	403 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	MARCH5	Q9NX47	278 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	GDE1	Q9NZC3	331 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	HES2	Q9Y543	173 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	PRRG1	O14668	218 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	N4BP3	O15049	544 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	CCL16	O15467	120 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	B4GALT3	O60512	393 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	LRP3	O75074	770 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	B3GAT3	O94766	335 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	STBD1	O95210	358 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	NPTXR	O95502	500 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	TSPAN15	O95858	294 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	LRG1	P02750	347 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	SLFN14	P0C7P3	912 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	CPA1	P15085	419 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	LIG1	P18858	919 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	OR1D2	P34982	312 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	OXCT1	P55809	520 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	PTEN	P60484	403 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	ID3	Q02535	119 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	DMWD	Q09019	674 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	TUSC3	Q13454	348 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	PPP2R5A	Q15172	486 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	MAPK6	Q16659	721 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	UBXN11	Q5T124	520 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	IQCE	Q6IPM2	695 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
UBP1-210	ENST00000486388	DCLK2	Q8N568	766 aa		5.19	□□□□□ -1.58

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