RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 TGFB1I1O43294 461 aa13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CST3P01034 146 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 EGFP01133 1207 aa13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 TNNC2P02585 160 aa13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 LHX1P48742 406 aa13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 ASIC1P78348 528 aa13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 TMEM196Q5HYL7 178 aa13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 FAM171BQ6P995 826 aa13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 LIMS2Q7Z4I7 341 aa13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 LONP2Q86WA8 852 aa13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 NELFCDQ8IXH7 590 aa13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 MYRFLQ96LU7 910 aa13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 SYT15Q9BQS2 421 aa13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CRTAC1Q9NQ79 661 aa13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 WNT6Q9Y6F9 365 aa13.52□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 RETP07949 1114 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 DLATP10515 647 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 PTMSP20962 102 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 BDNFP23560 247 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 PCSK1P29120 753 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 GALK1P51570 392 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CYP2J2P51589 502 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 USP46P62068 366 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 LMNB2Q03252 620 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 MTF1Q14872 753 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 ZNF77Q15935 545 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CCDC6Q16204 474 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 DUOXA2Q1HG44 320 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CFAP221Q4G0U5 840 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 RESP18Q5W5W9 173 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 FSIP1Q8NA03 581 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 ZNF507Q8TCN5 953 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 GPT2Q8TD30 523 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 MYLPFQ96A32 169 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 ELMO3Q96BJ8 720 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 MMS19Q96T76 1030 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 BLZF1Q9H2G9 400 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 GCNT4Q9P109 453 aa13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 ANTXRLA6NF34 631 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 GDF9O60383 454 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 RNF40O75150 1001 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CKMP06732 381 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CMA1P23946 247 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 GJA4P35212 333 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CACNA2D1P54289 1103 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 ZXDBP98169 803 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CYP27A1Q02318 531 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 FAM160A1Q05DH4 1040 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 MYO1EQ12965 1108 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 FAM26FQ5R3K3 315 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CEP68Q76N32 757 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 WDR5BQ86VZ2 330 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 WDR49Q8IV35 697 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 SYNPOQ8N3V7 929 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 SH3RF2Q8TEC5 729 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 ZNF516Q92618 1163 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CCDC127Q96BQ5 260 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 LINC00597Q9H2U6 94 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 DPEP3Q9H4B8 488 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 ECT2Q9H8V3 914 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 KIF9Q9HAQ2 790 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 SEMA4GQ9NTN9 838 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 TMEM30AQ9NV96 361 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 ZMYM5Q9UJ78 669 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CDH9Q9ULB4 789 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 LAMA1P25391 3075 aa13.5□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 SPAG17Q6Q759 2223 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 AXIN1O15169 862 aa13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms