RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ARL4CP56559 192 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 IYDQ6PHW0 289 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ANO5Q75V66 913 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 POU5F2Q8N7G0 328 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 LMO3Q8TAP4 145 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 NAT14Q8WUY8 206 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PDCD2LQ9BRP1 358 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 MIS12Q9H081 205 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 I3L4J1 428 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PDE5AO76074 875 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ADSSP30520 456 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 TMPRSS15P98073 1019 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 CAV1Q03135 178 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 CDC16Q13042 620 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 GSTCDQ8NEC7 633 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 KREMEN1Q96MU8 473 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SLC13A1Q9BZW2 595 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PACSIN3Q9UKS6 424 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 POTEJP0CG39 1038 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ACOT2P49753 483 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 TFDP1Q14186 410 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 C1orf220Q5T0J3 134 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 C10orf71Q711Q0 1435 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 NCAPG2Q86XI2 1143 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 MICALL2Q8IY33 904 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 GLIS1Q8NBF1 620 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 WRNIP1Q96S55 665 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa16.97■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 TNNI1P19237 187 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PSMC5P62195 406 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SPOPLQ6IQ16 392 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 RAPH1Q70E73 1250 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 BBOF1Q8ND07 529 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 OLIG1Q8TAK6 271 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM143Q96AN5 459 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 GCNAQ96QF7 691 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 TUBB6Q9BUF5 446 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB129Q9H1M3 183 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 WDR64B1ANS9 1081 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 MAGEB3O15480 346 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PSMC4P43686 418 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PPP2R3CQ969Q6 453 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ACAP3Q96P50 834 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 TBX20Q9UMR3 447 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 COL4A5P29400 1685 aa16.96■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SIGLEC16A6NMB1 481 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 WDR46O15213 610 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 TMCC1O94876 653 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 NR3C2P08235 984 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 ITGA2BP08514 1039 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 MAN1A1P33908 653 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 GSDMBQ8TAX9 411 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PXMP2Q9NR77 195 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 HACL1Q9UJ83 578 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 APPL1Q9UKG1 709 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 LOC100653049A0A140TA62 436 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 KRT34O76011 436 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 CENPUQ71F23 418 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 RHPN2Q8IUC4 686 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 C11orf70Q9BRQ4 267 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 GRIP2Q9C0E4 1043 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 UMODL1Q5DID0 1318 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 KAT6AQ92794 2004 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 ADARP55265 1226 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PTK6Q13882 451 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 B3GNT9Q6UX72 402 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 PHF24Q9UPV7 400 aa16.95■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 EPS8L1Q8TE68 723 aa16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 IFT43Q96FT9 208 aa16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 TBC1D22BQ9NU19 505 aa16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 KCND2Q9NZV8 630 aa16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 LGALS13Q9UHV8 139 aa16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF862O60290 1169 aa16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 IMPDH2P12268 514 aa16.94■□□□□ 0.3
CCSAP-204ENST00000483092 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms