RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482844.5

CRBN-208, Transcript of cereblon, human

TSL 4

Gene CRBN, Length 653 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRBN-208	ENST00000482844	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	UCP3	P55916	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	LOXL3	P58215	753 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	TUBA4A	P68366	448 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	PPP6C	O00743	305 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	ADORA2A	P29274	412 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	LY6K	Q17RY6	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	CNGA4	Q8IV77	575 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	MORC4	Q8TE76	937 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	HOOK2	Q96ED9	719 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	FAM167A	Q96KS9	214 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	C5orf34	Q96MH7	638 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	XPR1	Q9UBH6	696 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	EXOC3	O60645	756 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	EPHB1	P54762	984 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	MAPK7	Q13164	816 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	E2F2	Q14209	437 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	FCRL6	Q6DN72	434 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	TMX2	Q9Y320	296 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRBN-208	ENST00000482844	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	AP1G1	O43747	822 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	CSF1R	P07333	972 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	MYB	P10242	640 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	PLCD1	P51178	756 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844		Q6ZWC4	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	KIF3B	O15066	747 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	ERC2	O15083	957 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	ONECUT2	O95948	504 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	NPS	P0C0P6	89 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	AKAP5	P24588	427 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	FPR3	P25089	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	CERS1	P27544	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	SLC11A2	P49281	568 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	NEK2	P51955	445 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	GPSM2	P81274	684 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRBN-208	ENST00000482844	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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