RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482419.1

FAM208B-208, Transcript of family with sequence similarity 208 member B, human

TSL 2

Gene FAM208B, Length 424 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM208B-208	ENST00000482419	SP2	Q02086	613 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	LINC00473	A8K010	186 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	NXPH3	O95157	252 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	CSF1R	P07333	972 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	KCNA3	P22001	575 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	KLRC1	P26715	233 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	TIMP4	Q99727	224 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.83	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	TTLL1	O95922	423 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	ONECUT2	O95948	504 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	PTH2R	P49190	550 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	PDE6C	P51160	858 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	INSC	Q1MX18	579 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	PHKB	Q93100	1093 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	UROC1	Q96N76	676 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	SARG	Q9BW04	601 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419		A1L4Q6	167 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	CCP110	O43303	1012 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	RASSF9	O75901	435 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	ERBB2	P04626	1255 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	PCSK6	P29122	969 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	LIPA	P38571	399 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	PRKAG1	P54619	331 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	TREML2	Q5T2D2	321 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	FES	P07332	822 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	TRIM27	P14373	513 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	JUP	P14923	745 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	NDUFB7	P17568	137 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	ITPKB	P27987	946 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	ADORA2A	P29274	412 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	GNAL	P38405	381 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	CLCN2	P51788	898 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	SOX10	P56693	466 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM208B-208	ENST00000482419	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.8	□□□□□ -1.64

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