RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478887.1

SFI1-222, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-222	ENST00000478887		F8VP50	259 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF197	O14709	1029 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	FGF19	O95750	216 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	CAVIN2	O95810	425 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	CEBPB	P17676	345 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	SLC9A1	P19634	815 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	PON1	P27169	355 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	GRIK1	P39086	918 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF132	P52740	706 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	CACNA2D1	P54289	1103 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	DDR2	Q16832	855 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF394	Q53GI3	561 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	RRAGA	Q7L523	313 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	C12orf29	Q8N999	325 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	GIPC2	Q8TF65	315 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	FGF13	Q92913	245 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	FAM81B	Q96LP2	452 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	MYRFL	Q96LU7	910 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	IL21	Q9HBE4	155 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	KRT82	Q9NSB4	513 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	CDH7	Q9ULB5	785 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	LGALS16	A8MUM7	142 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	TADA3	O75528	432 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	AP1G2	O75843	785 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	TPM2	P07951	284 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	PAEP	P09466	180 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	FAM200B	P0CF97	657 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	MYL4	P12829	197 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	LAMP2	P13473	410 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	ATP1A3	P13637	1013 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	ANXA13	P27216	316 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	CDC25C	P30307	473 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	APBA1	Q02410	837 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	KCNMA1	Q12791	1236 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	MTMR3	Q13615	1198 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	TAF12	Q16514	161 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	POTEH	Q6S545	545 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	GAREM2	Q75VX8	874 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	STKLD1	Q8NE28	680 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	GPR152	Q8TDT2	470 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	ING5	Q8WYH8	240 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	SHC3	Q92529	594 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	SMO	Q99835	787 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	MED10	Q9BTT4	135 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	VPS16	Q9H269	839 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	CBX8	Q9HC52	389 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	GDE1	Q9NZC3	331 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	PTPRD	P23468	1912 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887		A0A1W2PRU2	124 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	BECN2	A8MW95	431 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	ANHX	E9PGG2	379 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887		O00370	1275 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	TNFRSF10B	O14763	440 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	F11	P03951	625 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	VDR	P11473	427 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	NPR3	P17342	541 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	RFX1	P22670	979 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	GABRR2	P28476	465 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	ADORA2B	P29275	332 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	SLC5A3	P53794	718 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	MFAP3	P55082	362 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	TEAD2	Q15562	447 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	SGO2	Q562F6	1265 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SFI1-222	ENST00000478887	GJB7	Q6PEY0	223 aa		10.05	□□□□□ -0.8

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