RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 PDGFRLQ15198 375 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 TAF12Q16514 161 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 TMEM92Q6UXU6 159 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 SYT13Q7L8C5 426 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 CBWD2Q8IUF1 395 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 CAMKK1Q8N5S9 505 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 TTC16Q8NEE8 873 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 USP33Q8TEY7 942 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 CD101Q93033 1021 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 ELMO3Q96BJ8 720 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 GCNAQ96QF7 691 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 TPSD1Q9BZJ3 242 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 KIF9Q9HAQ2 790 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 TRPC7Q9HCX4 862 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 SLC8A2Q9UPR5 921 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 SMC3Q9UQE7 1217 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 SOBPA7XYQ1 873 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 GCNT3O95395 438 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 CST3P01034 146 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 SPINK2P20155 84 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 DRD1P21728 446 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 PGFP49763 221 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 SHC2P98077 582 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 TSPY1Q01534 308 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 CUL4AQ13619 759 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 CFAP221Q4G0U5 840 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 EMC10Q5UCC4 262 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 NT5DC4Q86YG4 428 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 SCN4BQ8IWT1 228 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 ADGRF2Q8IZF7 708 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 TOP6BLQ8N6T0 577 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 LRRC52Q8N7C0 313 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 HVCN1Q96D96 273 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 ZNF560Q96MR9 790 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 ACCSQ96QU6 501 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 USP28Q96RU2 1077 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 ABCB6Q9NP58 842 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 INTS13Q9NVM9 706 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 EBF1Q9UH73 591 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 PTPRDP23468 1912 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 LNP1A1A4G5 178 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 C4orf47A7E2U8 309 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 LEFTY2O00292 366 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 TGFB1I1O43294 461 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 HUS1O60921 280 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 AKAP3O75969 853 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 OLFM2O95897 454 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 CYP17A1P05093 508 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 PDGFRBP09619 1106 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 CCDC192P0DO97 292 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 TCF3P15923 654 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 GARTP22102 1010 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 BDNFP23560 247 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 SEC13P55735 322 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 POSTNQ15063 836 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 RASSF3Q86WH2 238 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 CCDC33Q8N5R6 958 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 OLIG1Q8TAK6 271 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 PLEKHO2Q8TD55 490 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 ZNF516Q92618 1163 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 P2RY11Q96G91 374 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 SYT15Q9BQS2 421 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 DPEP3Q9H4B8 488 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 TMEM206Q9H813 350 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 OLFML3Q9NRN5 406 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 PKD1L2Q7Z442 2459 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 MYOFQ9NZM1 2061 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 ZNF840PA6NDX5 716 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 TRIM24O15164 1050 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 ATG13O75143 517 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 APBB3O95704 486 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 CKMP06732 381 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 KRT19P08727 400 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 USP17L7P0C7H9 530 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 C1QTNF9P0C862 333 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 HDCP19113 662 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 PNPLA4P41247 253 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 MAGEA11P43364 429 aa11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms