RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 CBWD2Q8IUF1 395 aa12.02□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 CCDC33Q8N5R6 958 aa12.02□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 PDILTQ8N807 584 aa12.02□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 MYLPFQ96A32 169 aa12.02□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 ELMO3Q96BJ8 720 aa12.02□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 ACBD6Q9BR61 282 aa12.02□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 CRTAC1Q9NQ79 661 aa12.02□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 SMPD4Q9NXE4 827 aa12.02□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 SPEGQ15772 3267 aa12.02□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 MYO16Q9Y6X6 1858 aa12.02□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa12.01□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa12.01□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 USP17L7P0C7H9 530 aa12.01□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP12.01□□□□□ -0.49
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ACTB-209ENST00000473257 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP12.01□□□□□ -0.493e-35■■□□□ 11.9
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ACTB-209ENST00000473257 FAM160A1Q05DH4 1040 aa12.01□□□□□ -0.49
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ACTB-209ENST00000473257 PLA2G2CQ5R387 149 aa12.01□□□□□ -0.49
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ACTB-209ENST00000473257 OSCP1Q8WVF1 389 aa12.01□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 CD101Q93033 1021 aa12.01□□□□□ -0.49
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ACTB-209ENST00000473257 ABL1P00519 1130 aa12□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 TMEM191BP0C7N4 346 aa12□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 HDCP19113 662 aa12□□□□□ -0.49
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ACTB-209ENST00000473257 GARTP22102 1010 aa12□□□□□ -0.49
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ACTB-209ENST00000473257 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
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ACTB-209ENST00000473257 FAM171BQ6P995 826 aa12□□□□□ -0.49
ACTB-209ENST00000473257 TMEM86AQ8N2M4 240 aa12□□□□□ -0.49
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ACTB-209ENST00000473257 EMC10Q5UCC4 262 aa11.99□□□□□ -0.49
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