RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471364.1

RUBCN-208, Transcript of RUN and cysteine rich domain containing beclin 1 interacting protein, human

TSL 3

Gene RUBCN, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUBCN-208	ENST00000471364	PRKCQ	Q04759	706 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	PTK2	Q05397	1052 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	KIF5A	Q12840	1032 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	PSMD5	Q16401	504 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC18A3	Q16572	532 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	CEP57	Q86XR8	500 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	HASPIN	Q8TF76	798 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	POLI	Q9UNA4	740 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364		A0A087X0T9	212 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	SPTLC1	O15269	473 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	CCL16	O15467	120 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	TH	P07101	528 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	C8A	P07357	584 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	FAM228B	P0C875	321 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	ANXA13	P27216	316 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	MAGEA9	P43362	315 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	ACOT2	P49753	483 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	CLDN10	P78369	228 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	NTHL1	P78549	312 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	MAPK6	Q16659	721 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	DCLK2	Q8N568	766 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	TSC1	Q92574	1164 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF516	Q92618	1163 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	FGF13	Q92913	245 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	FZD8	Q9H461	694 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	NENF	Q9UMX5	172 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RUBCN-208	ENST00000471364	CTAGE9	A4FU28	777 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	ABLIM1	O14639	778 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	TOM1L1	O75674	476 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	KIF4A	O95239	1232 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	SV2A	Q7L0J3	742 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	FAM84A	Q96KN4	292 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	NCDN	Q9UBB6	729 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	COL4A3	Q01955	1670 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	PTPRJ	Q12913	1337 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	FAM170B	A6NMN3	283 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	ACKR2	O00590	384 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	NCAM2	O15394	837 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	CLDN3	O15551	220 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	FAM189A1	O60320	539 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	MOCS3	O95396	460 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	POU2F2	P09086	479 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	SDHB	P21912	280 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	PROZ	P22891	400 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	SEZ6	Q53EL9	994 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RUBCN-208	ENST00000471364	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25

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