RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470243.5

SRRM1-208, Transcript of serine and arginine repetitive matrix 1, human

TSL 5

Gene SRRM1, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRRM1-208	ENST00000470243	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		5	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		5	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	ADGRB3	O60242	1522 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	ZNF623	O75123	536 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	TCEA3	O75764	348 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	MT-ND5	P03915	603 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	ITGB3	P05106	788 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	TH	P07101	528 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	INSRR	P14616	1297 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	FGFR2	P21802	821 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	FDXR	P22570	491 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	KLRC1	P26715	233 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	MAPK10	P53779	464 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	BTK	Q06187	659 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	TCF15	Q12870	199 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	CRHR2	Q13324	411 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	FAM89A	Q96GI7	184 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	SMO	Q99835	787 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	BDH2	Q9BUT1	245 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	XPR1	Q9UBH6	696 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	HESX1	Q9UBX0	185 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	ABCA3	Q99758	1704 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	MST1R	Q04912	1400 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	PTCH1	Q13635	1447 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	NRAP	Q86VF7	1730 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	MYO1C	O00159	1063 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	DCLK1	O15075	740 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	FGF18	O76093	207 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	FGFR4	P22455	802 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	HSPA7	P48741	367 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	HSD11B2	P80365	405 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	MC2R	Q01718	297 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	OCA2	Q04671	838 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	TRIM14	Q14142	442 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61	7e-16	■■□□□ 11.5
SRRM1-208	ENST00000470243	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	TRIB1	Q96RU8	372 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	PNKP	Q96T60	521 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	CHST8	Q9H2A9	424 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	MID2	Q9UJV3	735 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	MBD5	Q9P267	1494 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SRRM1-208	ENST00000470243	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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