RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462421.1

DDX39B-216, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 618 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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DDX39B-216ENST00000462421 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.891e-6■■■□□ 17.2
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DDX39B-216ENST00000462421 HEBP1Q9NRV9 189 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 TMLHEQ9NVH6 421 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 COMMD8Q9NX08 183 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 MAN1B1Q9UKM7 699 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 RAB23Q9ULC3 237 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 KRBA1A5PL33 1030 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-216ENST00000462421 H0Y858 1186 aa9.49□□□□□ -0.89
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