RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 SPATA17Q96L03 361 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 SDCBP2Q9H190 292 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 LTB4R2Q9NPC1 389 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 OBP2AQ9NY56 170 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 ZMYM5Q9UJ78 669 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 HLA-DRAP01903 254 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 ENPEPQ07075 957 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 PPP3CAQ08209 521 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 UBXN2BQ14CS0 331 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 CMTM8Q8IZV2 173 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 MAB21L3Q8N8X9 362 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 SMARCE1Q969G3 411 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 DPYSL4O14531 572 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 ASS1P00966 412 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 KRT13P13646 458 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.633e-6■■■□□ 19.1
HOXB3-202ENST00000460160 GCLMP48507 274 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 TXNDC8Q6A555 127 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 YAF2Q8IY57 180 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 TAF4BQ92750 862 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 OSBPL6Q9BZF3 934 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM30AQ9NV96 361 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 FRYLO94915 3013 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 MYH10P35580 1976 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 FAM170BA6NMN3 283 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 CHADO15335 359 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 GRIK1P39086 918 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 PIK3CAP42336 1068 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 ANGPT1Q15389 498 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 SPOPLQ6IQ16 392 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF852Q6ZMS4 543 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 MON1AQ86VX9 555 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 CEP295NLQ96MC4 621 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 B3GNT5Q9BYG0 378 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 SOBPA7XYQ1 873 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 F8VP50 259 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 P4HA1P13674 534 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 TARSP26639 723 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 ASPAP45381 313 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 CACNA2D1P54289 1103 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 TAS1R2Q8TE23 839 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 CCL26Q9Y258 94 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 PIAS3Q9Y6X2 628 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 PATJQ8NI35 1801 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 FAM186AA6NE01 2351 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 CLDN5O00501 218 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 TRIM66O15016 1216 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 AVPR1AP37288 418 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 MRE11P49959 708 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 ADSSL1Q8N142 457 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 BPIFB1Q8TDL5 484 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 ZFYVE19Q96K21 471 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 C8orf48Q96LL4 319 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 ELOVL4Q9GZR5 314 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.635e-7■■■■■ 163.5
HOXB3-202ENST00000460160 CFAP54Q96N23 3096 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 CETN3O15182 167 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 KINO60870 393 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 ANXA13P27216 316 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 PMS1P54277 932 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 USP46P62068 366 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF687Q8N1G0 1237 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 NELL2Q99435 816 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 MMRN2Q9H8L6 949 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-202ENST00000460160 FZD5Q13467 585 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXB3-202ENST00000460160 ANKRD40Q6AI12 368 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXB3-202ENST00000460160 CLDN23Q96B33 292 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXB3-202ENST00000460160 TNIP3Q96KP6 325 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXB3-202ENST00000460160 TTLL2Q9BWV7 592 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXB3-202ENST00000460160 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM8AQ9HCN3 771 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXB3-202ENST00000460160 TDP1Q9NUW8 608 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXB3-202ENST00000460160 HMGXB4Q9UGU5 601 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXB3-202ENST00000460160 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
HOXB3-202ENST00000460160 HELZP42694 1942 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
HOXB3-202ENST00000460160 MAN2B1O00754 1011 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-202ENST00000460160 EPB41P11171 864 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-202ENST00000460160 GTF2H1P32780 548 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-202ENST00000460160 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-202ENST00000460160 NOP14P78316 857 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-202ENST00000460160 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-202ENST00000460160 SLC22A12Q96S37 553 aa25.19■■□□□ 1.62
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