RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 KIAA0355O15063 1070 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF185O15231 689 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 PSTPIP1O43586 416 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 NCK2O43639 380 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 TIMP1P01033 207 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 PDGFRBP09619 1106 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 LBX1P52954 281 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 RWDD2BP57060 319 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRIM60Q495X7 471 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 CCDC181Q5TID7 509 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 DNAJC24Q6P3W2 148 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 DCUN1D2Q6PH85 259 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 MAMSTRQ6ZN01 415 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 POLNQ7Z5Q5 900 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 TTC30AQ86WT1 665 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 RHOT1Q8IXI2 618 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 SCML4Q8N228 414 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 RNF169Q8NCN4 708 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 C3orf58Q8NDZ4 430 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 PKNOX2Q96KN3 472 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 COLEC11Q9BWP8 271 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 ARFGAP3Q9NP61 516 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM51Q9NW97 253 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 OGFRQ9NZT2 677 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 LRFN2Q9ULH4 789 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 CASTOR2A6NHX0 329 aa9.74□□□□□ -0.85
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CCNDBP1-202ENST00000444658 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPOPO43791 374 aa9.74□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 DDHD2O94830 711 aa9.74□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 ERBB2P04626 1255 aa9.74□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 GLI1P08151 1106 aa9.74□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 CXCR5P32302 372 aa9.74□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 PCK1P35558 622 aa9.74□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 COPS2P61201 443 aa9.74□□□□□ -0.85
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CCNDBP1-202ENST00000444658 PDE4CQ08493 712 aa9.74□□□□□ -0.85
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CCNDBP1-202ENST00000444658 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa9.74□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 PMF1Q6P1K2 205 aa9.74□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 PAQR9Q6ZVX9 377 aa9.74□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 OSTM1Q86WC4 334 aa9.74□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF280BQ86YH2 543 aa9.74□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 ABI1Q8IZP0 508 aa9.74□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 FUKQ8N0W3 1084 aa9.74□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 UBA3Q8TBC4 463 aa9.74□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 MAIP1Q8WWC4 291 aa9.74□□□□□ -0.85
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CCNDBP1-202ENST00000444658 PAAF1Q9BRP4 392 aa9.74□□□□□ -0.85
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CCNDBP1-202ENST00000444658 PRDM10Q9NQV6 1147 aa9.74□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 ASNSD1Q9NWL6 643 aa9.74□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 EFR3BQ9Y2G0 817 aa9.74□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 CITO14578 2027 aa9.74□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 NPR3P17342 541 aa9.73□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMARCB1Q12824 385 aa9.73□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 MAP9Q49MG5 647 aa9.73□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 EFHC1Q5JVL4 640 aa9.73□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 MFSD5Q6N075 450 aa9.73□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa9.73□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 KATNAL2Q8IYT4 538 aa9.73□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 RCOR2Q8IZ40 523 aa9.73□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 EXD1Q8NHP7 514 aa9.73□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC2A14Q8TDB8 520 aa9.73□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 TOP1MTQ969P6 601 aa9.73□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 VWCEQ96DN2 955 aa9.73□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 PKMYT1Q99640 499 aa9.73□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 SYT15Q9BQS2 421 aa9.73□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 CNPY3Q9BT09 278 aa9.73□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 MFRPQ9BY79 579 aa9.73□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 GOLPH3Q9H4A6 298 aa9.73□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa9.73□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 C2CD4BA6NLJ0 364 aa9.72□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 DPYSL4O14531 572 aa9.72□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 NRP1O14786 923 aa9.72□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 FSCN2O14926 492 aa9.72□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 SART1O43290 800 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 CEP104O60308 925 aa9.72□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 TADA2AO75478 443 aa9.72□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 BAIAP3O94812 1187 aa9.72□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 FBXO21O94952 628 aa9.72□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 EFEMP2O95967 443 aa9.72□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 MYCP01106 439 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
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