RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 B4GALT4O60513 344 aa5.07□□□□□ -1.6
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RPS3AP54-201ENST00000435535 C14orf119Q9NWQ9 140 aa5.06□□□□□ -1.6
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RPS3AP54-201ENST00000435535 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAN1Q9Y2M0 1017 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa5.06□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 ELP1O95163 1332 aa5.05□□□□□ -1.6
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RPS3AP54-201ENST00000435535 GRXCR1A8MXD5 290 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL18BPO95998 194 aa5.05□□□□□ -1.6
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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