RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 NLRP9Q7RTR0 991 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 DDHD1Q8NEL9 900 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 HEY2Q9UBP5 337 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 COL15A1P39059 1388 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ADGRA2Q96PE1 1338 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 RSPH10B2B2RC85 870 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 HMBSP08397 361 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 RSPH10BP0C881 870 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 GPD1P21695 349 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 RXRBP28702 533 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMD7P51665 324 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 OVGP1Q12889 678 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SBK1Q52WX2 424 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 NYAP1Q6ZVC0 841 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF786Q8N393 782 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM71DQ8N9W8 422 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 LPAR1Q92633 364 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CLCA2Q9UQC9 943 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CD4P01730 458 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PGK2P07205 417 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 TARSP26639 723 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 POU4F1Q01851 419 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGEF7Q14155 803 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 EFHC1Q5JVL4 640 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 KCTD17Q8N5Z5 321 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 C17orf80Q9BSJ5 609 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 APPL1Q9UKG1 709 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A087X0T9 212 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP11.42□□□□□ -0.581e-5■□□□□ 8.6
EFTUD2-202ENST00000426333 RGS5O15539 181 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 STRNO43815 780 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM228BP0C875 321 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 GYS1P13807 737 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP3CCP48454 512 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 C3orf20Q8ND61 904 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 TNIP2Q8NFZ5 429 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 RIT2Q99578 217 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 L2HGDHQ9H9P8 463 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 EFCAB1Q9HAE3 211 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SPASTQ9UBP0 616 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 DOT1LQ8TEK3 1739 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 F8W810 466 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA8TH3BQL2 631 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SOAT2O75908 522 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 USP1O94782 785 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SUPT7LO94864 414 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 GTF2H1P32780 548 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXO4P98177 505 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 TP53BP2Q13625 1128 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 EPC2Q52LR7 807 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 KDM7AQ6ZMT4 941 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC25A41Q8N5S1 370 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 DDI1Q8WTU0 396 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 NAT9Q9BTE0 207 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 GPR63Q9BZJ6 419 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 GIMAP4Q9NUV9 329 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ZSCAN32Q9NX65 697 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 NYAP2Q9P242 653 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PDE5AO76074 875 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 EPHB2P29323 1055 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 NPEPPSP55786 919 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 HPCAP84074 193 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ANGPT1Q15389 498 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 MFSD14CQ5VZR4 134 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 IYDQ6PHW0 289 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ATG9AQ7Z3C6 839 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC7A14Q8TBB6 771 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS50Q96JG6 964 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PHTF1Q9UMS5 762 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 THRAP10827 490 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 EMC2Q15006 297 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP78Q5JTW2 689 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR93Q6P2C0 686 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 FUT8Q9BYC5 575 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 DCLRE1BQ9H816 532 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 TADA2AO75478 443 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 RHOBTB1O94844 696 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 IL18RAPO95256 599 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMA3P25788 255 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 RGS2P41220 211 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT78Q8N1N4 520 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 TPCN2Q8NHX9 752 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 MTERF3Q96E29 417 aa11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms