RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC106Q9BWC9 280 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PITPNM3Q9BZ71 974 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PXMP2Q9NR77 195 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 USP21Q9UK80 565 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A088AWK7 358 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CYB561D2O14569 222 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 AHCYL1O43865 530 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 APOC2P02655 101 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 AMPD1P23109 780 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SERPINB3P29508 390 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 NOMO1Q15155 1222 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D25Q3MII6 688 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 USP6NLQ92738 828 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 NGLY1Q96IV0 654 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC25Q96NG3 672 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FZD8Q9H461 694 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TLR3O15455 904 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SPOPO43791 374 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 INHBCP55103 352 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CTBSQ01459 385 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CDC16Q13042 620 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 STEAP4Q687X5 459 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 IRGCQ6NXR0 463 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC4A11Q8NBS3 891 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 NT5C3BQ969T7 300 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 IMPG2Q9BZV3 1241 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 DCLRE1BQ9H816 532 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 LRCH1Q9Y2L9 728 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SMIM23A6NLE4 172 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 KRT13P13646 458 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SFNP31947 248 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TNFSF9P41273 254 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SERPINB4P48594 390 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SNX1Q13596 522 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SPARCL1Q14515 664 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GPD1LQ8N335 351 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FEZF2Q8TBJ5 459 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 LHX5Q9H2C1 402 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAJB4Q9UDY4 337 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RASAL2Q9UJF2 1139 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ANAPC5Q9UJX4 755 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PSAT1Q9Y617 370 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SCN1AP35498 2009 aa3.81□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 H0YHG0 523 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 EXTL3O43909 919 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ADCY3O60266 1144 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 ADCY1Q08828 1119 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 STRN3Q13033 797 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GRM1Q13255 1194 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZPBP2Q6X784 338 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GDAP1Q8TB36 358 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CHURC1Q8WUH1 139 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC7A3Q8WY07 619 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ATG4CQ96DT6 458 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 OLFM3Q96PB7 478 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MAGEB5Q9BZ81 275 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PPM1HQ9ULR3 514 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM159BA6NKW6 160 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 C2CD4BA6NLJ0 364 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA31D3P0C874 917 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SMIM18P0DKX4 95 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 AOC1P19801 751 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CRABP2P29373 138 aa3.8□□□□□ -1.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 PCK1P35558 622 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TGFB2P61812 414 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MTMR1Q13613 665 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SEL1L2Q5TEA6 688 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 EEF1DP3Q658K8 133 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CYP4F22Q6NT55 531 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MIER3Q7Z3K6 550 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 LPAR1Q92633 364 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TBK1Q9UHD2 729 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF180Q9UJW8 692 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FEM1BQ9UK73 627 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM64CA6NLI5 447 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR25O00155 361 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 VIMP08670 466 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
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