RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 SDK1Q7Z5N4 2213 aa20.7■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 EPG5Q9HCE0 2579 aa20.7■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 SOBPA7XYQ1 873 aa20.7■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 ATP2C2O75185 946 aa20.7■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 APBB3O95704 486 aa20.7■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 TNNC2P02585 160 aa20.7■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 GRIK1P39086 918 aa20.7■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 CYP27A1Q02318 531 aa20.7■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 MYO1EQ12965 1108 aa20.7■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 USP4Q13107 963 aa20.7■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 NR1H3Q13133 447 aa20.7■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 PLK5Q496M5 336 aa20.7■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 RNF43Q68DV7 783 aa20.7■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.7■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa20.7■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 MYLPFQ96A32 169 aa20.7■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 SYT15Q9BQS2 421 aa20.7■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM206Q9H813 350 aa20.7■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 SIX4Q9UIU6 781 aa20.7■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 ACACBO00763 2458 aa20.7■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 AKAP3O75969 853 aa20.69■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 ABL1P00519 1130 aa20.69■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 PDGFRBP09619 1106 aa20.69■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 HDCP19113 662 aa20.69■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 BDNFP23560 247 aa20.69■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 LIMK1P53667 647 aa20.69■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 SOWAHAQ2M3V2 549 aa20.69■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 EML3Q32P44 896 aa20.69■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 SYT13Q7L8C5 426 aa20.69■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 GPD1LQ8N335 351 aa20.69■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 PDILTQ8N807 584 aa20.69■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 TSTD1Q8NFU3 115 aa20.69■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 HPDLQ96IR7 371 aa20.69■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 MMS19Q96T76 1030 aa20.69■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 PKMYT1Q99640 499 aa20.69■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 TPSD1Q9BZJ3 242 aa20.69■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 LINC00597Q9H2U6 94 aa20.69■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 VPS45Q9NRW7 570 aa20.69■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 GDAP2Q9NXN4 497 aa20.69■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa20.69■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa20.69■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 ATG2BQ96BY7 2078 aa20.68■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 RHOBTB1O94844 696 aa20.68■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 LMO2P25791 158 aa20.68■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 ANXA13P27216 316 aa20.68■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 ALCAMQ13740 583 aa20.68■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.68■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 OR5B17Q8NGF7 314 aa20.68■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.68■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 MYRFLQ96LU7 910 aa20.68■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 EDEM2Q9BV94 578 aa20.68■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 OLFML3Q9NRN5 406 aa20.68■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 CLSTN1O94985 981 aa20.67■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 NFATC1O95644 943 aa20.67■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 PDCP20941 246 aa20.67■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 C2orf27AQ580R0 203 aa20.67■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 PLA2G2CQ5R387 149 aa20.67■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.67■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 CXorf38Q8TB03 319 aa20.67■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 INTS13Q9NVM9 706 aa20.67■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa20.67■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 CDH9Q9ULB4 789 aa20.67■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 GABRDO14764 452 aa20.66■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 CAVIN2O95810 425 aa20.66■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.66■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.66■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 SPATA18Q8TC71 538 aa20.66■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 HPS3Q969F9 1004 aa20.66■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 SNX25Q9H3E2 840 aa20.66■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.66■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.66■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 GCNT4Q9P109 453 aa20.66■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 PTPRJQ12913 1337 aa20.66■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 OBSL1O75147 1896 aa20.65■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 A0A087X0B3 334 aa20.65■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF233A6NK53 670 aa20.65■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 LEFTY2O00292 366 aa20.65■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 MAGEA11P43364 429 aa20.65■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 PDE6CP51160 858 aa20.65■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 USP46P62068 366 aa20.65■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 RESTQ13127 1097 aa20.65■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.65■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 ANO7Q6IWH7 933 aa20.65■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa20.65■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 FAM171BQ6P995 826 aa20.65■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa20.65■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.65■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC33Q8N5R6 958 aa20.65■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 RDH13Q8NBN7 331 aa20.65■□□□□ 0.9
UBXN4-202ENST00000415164 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms