RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 SIP14410 1827 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 PARP14Q460N5 1801 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 MEIS2O14770 477 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 SLC37A4O43826 429 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 B4GALT4O60513 344 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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CCL20-202ENST00000409189 PPP1R2P41236 205 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 BEX3Q00994 111 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 SETQ01105 290 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 SLC9A5Q14940 896 aa7.23□□□□□ -1.25
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CCL20-202ENST00000409189 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa7.23□□□□□ -1.25
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CCL20-202ENST00000409189 ZSCAN30Q86W11 494 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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CCL20-202ENST00000409189 CALML4Q96GE6 196 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 PEX11GQ96HA9 241 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 KCNMB3Q9NPA1 279 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 PRKAG3Q9UGI9 489 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 ASTN1O14525 1302 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 FRMPD4Q14CM0 1322 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 NOBOXO60393 691 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 CYP3A4P08684 503 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 CYP2C9P11712 490 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 LTBRP36941 435 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 NBL1P41271 181 aa7.22□□□□□ -1.25
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CCL20-202ENST00000409189 OAZ1P54368 228 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 RBM10P98175 930 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 SLC7A5Q01650 507 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 PLP2Q04941 152 aa7.22□□□□□ -1.25
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CCL20-202ENST00000409189 KCNB1Q14721 858 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 KARSQ15046 597 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
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CCL20-202ENST00000409189 TMEM119Q4V9L6 283 aa7.22□□□□□ -1.25
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CCL20-202ENST00000409189 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa7.22□□□□□ -1.25
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CCL20-202ENST00000409189 SLC5A4Q9NY91 659 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 FAM184BQ9ULE4 1060 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL20-202ENST00000409189 RWDD3Q9Y3V2 267 aa7.22□□□□□ -1.25
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CCL20-202ENST00000409189 C2orf71A6NGG8 1288 aa7.21□□□□□ -1.26
CCL20-202ENST00000409189 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CCL20-202ENST00000409189 PPM1BO75688 479 aa7.21□□□□□ -1.26
CCL20-202ENST00000409189 POLR2MP0CAP2 368 aa7.21□□□□□ -1.26
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CCL20-202ENST00000409189 SEPHS1P49903 392 aa7.21□□□□□ -1.26
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CCL20-202ENST00000409189 ERVK-21P61565 698 aa7.21□□□□□ -1.26
CCL20-202ENST00000409189 PSMC6P62333 389 aa7.21□□□□□ -1.26
CCL20-202ENST00000409189 ZXDAP98168 799 aa7.21□□□□□ -1.26
CCL20-202ENST00000409189 AMPD3Q01432 767 aa7.21□□□□□ -1.26
CCL20-202ENST00000409189 AMPD2Q01433 879 aa7.21□□□□□ -1.26
CCL20-202ENST00000409189 ITGA7Q13683 1181 aa7.21□□□□□ -1.26
CCL20-202ENST00000409189 TMEM132BQ14DG7 1078 aa7.21□□□□□ -1.26
CCL20-202ENST00000409189 NCAPHQ15003 741 aa7.21□□□□□ -1.26
CCL20-202ENST00000409189 CLUL1Q15846 466 aa7.21□□□□□ -1.26
CCL20-202ENST00000409189 HYIQ5T013 277 aa7.21□□□□□ -1.26
CCL20-202ENST00000409189 CNNM4Q6P4Q7 775 aa7.21□□□□□ -1.26
CCL20-202ENST00000409189 USP17L6PQ6QN14 398 aa7.21□□□□□ -1.26
CCL20-202ENST00000409189 EP400NLQ6ZTU2 488 aa7.21□□□□□ -1.26
CCL20-202ENST00000409189 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.21□□□□□ -1.26
CCL20-202ENST00000409189 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CCL20-202ENST00000409189 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
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