RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 ASGR1P07306 291 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 RARAP10276 462 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 CAP1Q01518 475 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 IFT88Q13099 833 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 PDCLQ13371 301 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 FBXO47Q5MNV8 452 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 CAPNS2Q96L46 248 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF560Q96MR9 790 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 TRIM31Q9BZY9 425 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 DPH5Q9H2P9 285 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 KIAA1257Q9ULG3 409 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM187AA6NFU0 413 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 FSCN2O14926 492 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 ERBB2P04626 1255 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 KRT3P12035 628 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 KCNE1P15382 129 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF24P17028 368 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 CYP1B1Q16678 543 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 FBXW10Q5XX13 1052 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 SPATA21Q7Z572 469 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 SERINC5Q86VE9 423 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 JAMLQ86YT9 394 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 KATNAL2Q8IYT4 538 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 UBA3Q8TBC4 463 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 WNT8BQ93098 351 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM114A2Q9NRY5 505 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 RNF186Q9NXI6 227 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 WDR35Q9P2L0 1181 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 PCYOX1Q9UHG3 505 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 TSPAN16Q9UKR8 245 aa10.53□□□□□ -0.72
LRRTM4-202ENST00000409093 SIGLEC16A6NMB1 481 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 F8VP50 259 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 PSMA2P25787 234 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 ECHS1P30084 290 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 GPD2P43304 727 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 NKX3-2P78367 333 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 OGDHQ02218 1023 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 STILQ15468 1287 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 KCNA10Q16322 511 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 DEFB115Q30KQ5 88 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 XKR4Q5GH76 650 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 TTC27Q6P3X3 843 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 LCLAT1Q6UWP7 414 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 ACOT1Q86TX2 421 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 XYLT1Q86Y38 959 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 CCDC105Q8IYK2 499 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 C12orf29Q8N999 325 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 ARRDC4Q8NCT1 418 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 OR6B3Q8NGW1 331 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 EXD1Q8NHP7 514 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 MAIP1Q8WWC4 291 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 SEC14L1Q92503 715 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 RUNDC3BQ96NL0 473 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 ERP44Q9BS26 406 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 KLHL11Q9NVR0 708 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 THSD7BQ9C0I4 1608 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 KPNA7A9QM74 516 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 PIRO00625 290 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 RALAP11233 206 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 TCF4P15884 667 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 CYP3A5P20815 502 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 COILP38432 576 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 GGCXP38435 758 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 PNPLA4P41247 253 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 RANBP1P43487 201 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 FNTAP49354 379 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 TAF6P49848 677 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 SOWAHAQ2M3V2 549 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 ODF2Q5BJF6 829 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 NIPA2Q8N8Q9 360 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 JOSD2Q8TAC2 188 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM71BQ8TC56 605 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 C1orf54Q8WWF1 131 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 RUFY1Q96T51 708 aa10.52□□□□□ -0.73
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM49BQ9NUQ9 324 aa10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms