RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 ARSHQ5FYA8 562 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 KCNN1Q92952 543 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 MYRFLQ96LU7 910 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 DPP3Q9NY33 737 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 PILRBQ9UKJ0 227 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 LOC400499M0QZD8 3231 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 C2orf78A6NCI8 922 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 KPNA7A9QM74 516 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 H0YCG3 227 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 SGK1O00141 431 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 NFATC1O95644 943 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 CFIP05156 583 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 ITPKAP23677 461 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 ZXDBP98169 803 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 SCAPQ12770 1279 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 COL28A1Q2UY09 1125 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 MAP7D1Q3KQU3 841 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 LYSMD4Q5XG99 296 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 HDDC3Q8N4P3 179 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 ALLCQ8N6M5 410 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 COL26A1Q96A83 441 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 SPACA7Q96KW9 195 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 PLA2G4BP0C869 781 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 TIE1P35590 1138 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 SLC6A11P48066 632 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 TSPY1Q01534 308 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 MESP2Q0VG99 397 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 HYIQ5T013 277 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 EMC10Q5UCC4 262 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 IL17RCQ8NAC3 791 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 OR2I1PQ8NGU4 316 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 WHAMMQ8TF30 809 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 ASB7Q9H672 318 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 SLC6A14Q9UN76 642 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 HELZP42694 1942 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 SEC24BO95487 1268 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 TCF3P15923 654 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 HDCP19113 662 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC142Q17RM4 750 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 DEFB119Q8N690 84 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP20.73■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 C2CD2Q9Y426 696 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 CEP192Q8TEP8 1941 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 GON4LQ3T8J9 2241 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 K7ENM7 598 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 OPHN1O60890 802 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 CD59P13987 128 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 DUOXA1Q1HG43 343 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF423Q2M1K9 1284 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 SV2CQ496J9 727 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 SPDYCQ5MJ68 293 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 KCND2Q9NZV8 630 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 PCDH15Q96QU1 1955 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 TISP43B9A030 160 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 CYP17A1P05093 508 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 PRPHP41219 470 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 DPP6P42658 865 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 NEK4P51957 841 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 KCNB1Q14721 858 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 PGBD3Q8N328 593 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 MINDY1Q8N5J2 469 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 HMGB4Q8WW32 186 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 CAMK1GQ96NX5 476 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 PKMYT1Q99640 499 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 ACBD6Q9BR61 282 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 REEP2Q9BRK0 252 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 CAPN10Q9HC96 672 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 ABCB6Q9NP58 842 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms