RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM35AQ86V20 835 aa16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMC8Q8IU68 726 aa16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCN4BQ8IWT1 228 aa16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NXPE3Q969Y0 559 aa16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYRFLQ96LU7 910 aa16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LPIN3Q9BQK8 851 aa16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MED10Q9BTT4 135 aa16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRRC3Q9BY71 257 aa16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAB2Q9NYJ8 693 aa16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UNC80Q8N2C7 3258 aa16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SOBPA7XYQ1 873 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PES1O00541 588 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM200BP0CF97 657 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC9A1P19634 815 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACO1P21399 889 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDR2Q16832 855 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF394Q53GI3 561 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARHGAP17Q68EM7 881 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PAQR9Q6ZVX9 377 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC4A11Q8NBS3 891 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC2A14Q8TDB8 520 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FGF13Q92913 245 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYFIP2Q96F07 1278 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GCNAQ96QF7 691 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CRACR2AQ9BSW2 395 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HSD3B7Q9H2F3 369 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PNPLA8Q9NP80 782 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COMMD8Q9NX08 183 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CNTN6Q9UQ52 1028 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VWA8A3KMH1 1905 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC38A8A6NNN8 435 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 F8VP50 259 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLDN5O00501 218 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AP1G2O75843 785 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VDRP11473 427 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYL4P12829 197 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LAMP2P13473 410 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPR15P49685 360 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COPB1P53618 953 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ORC1Q13415 861 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IQCB1Q15051 598 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STILQ15468 1287 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC5A9Q2M3M2 681 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM270Q6UE05 265 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RRAGAQ7L523 313 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARHGEF19Q8IW93 802 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPAS3Q8IXF0 933 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C12orf29Q8N999 325 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ITFG1Q8TB96 612 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GIPC2Q8TF65 315 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYADMQ96S97 322 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TTLL2Q9BWV7 592 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VPS16Q9H269 839 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLCB1Q9NQ66 1216 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRT82Q9NSB4 513 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM49BQ9NUQ9 324 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LGALS16A8MUM7 142 aa16.21■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC130P13994 396 aa16.21■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP16.21■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP3CCP48454 512 aa16.21■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF132P52740 706 aa16.21■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC8A3P57103 927 aa16.21■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa16.21■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SGO2Q562F6 1265 aa16.21■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KREMEN1Q96MU8 473 aa16.21■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL21Q9HBE4 155 aa16.21■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGSF9Q9P2J2 1179 aa16.21■□□□□ 0.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYO9BQ13459 2157 aa16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSC2P49815 1807 aa16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MOSPD3O75425 235 aa16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPR3P17342 541 aa16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GABRR2P28476 465 aa16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCR2P41597 374 aa16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDR1P51861 262 aa16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCNMA1Q12791 1236 aa16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GAREM2Q75VX8 874 aa16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MTSS1LQ765P7 747 aa16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF135Q8IUD6 432 aa16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUP93Q8N1F7 819 aa16.2■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms