RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379918.8

CAGE1-203, Transcript of cancer antigen 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAGE1, Length 2,877 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAGE1-203	ENST00000379918	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	ALOX15B	O15296	676 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	MAP3K13	O43283	966 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	HOXC6	P09630	235 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	KRT3	P12035	628 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	CCNB1	P14635	433 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	ABL2	P42684	1182 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	NAMPT	P43490	491 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	CLCN3	P51790	818 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	IGBP1	P78318	339 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	NR1H3	Q13133	447 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	PDK4	Q16654	411 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	CCDC142	Q17RM4	750 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	CES4A	Q5XG92	561 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	RNF43	Q68DV7	783 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	LONP2	Q86WA8	852 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	FBXO27	Q8NI29	283 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	BTBD7	Q9P203	1132 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	MCM3AP	O60318	1980 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	CFAP69	A5D8W1	941 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	CYB561D2	O14569	222 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	ABLIM1	O14639	778 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	HCRT	O43612	131 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	ADCY3	O60266	1144 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	PEX11A	O75192	247 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	STAM2	O75886	525 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	MIP	P30301	263 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	ELK3	P41970	407 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	ATP11A	P98196	1134 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	TRPC3	Q13507	836 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	RIPK1	Q13546	671 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	BMPR2	Q13873	1038 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	CENPU	Q71F23	418 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	RFX6	Q8HWS3	928 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	C12orf29	Q8N999	325 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	JDP2	Q8WYK2	163 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	TTC17	Q96AE7	1141 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	MIEF2	Q96C03	454 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	SYNC	Q9H7C4	482 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	PICK1	Q9NRD5	415 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	SIX4	Q9UIU6	781 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	TRIP11	Q15643	1979 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	KBTBD13	C9JR72	458 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	ATG7	O95352	703 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	POTEJ	P0CG39	1038 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	BGN	P21810	368 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	RGS7	P49802	495 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	STAT5B	P51692	787 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	RTP1	P59025	263 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	IRX4	P78413	519 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	FAAP100	Q0VG06	881 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	MORF4L2	Q15014	288 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	RELL1	Q8IUW5	271 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	RDM1	Q8NG50	284 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	MZB1	Q8WU39	189 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	CFAP36	Q96G28	342 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	STK32B	Q9NY57	414 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CAGE1-203	ENST00000379918	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		7.38	□□□□□ -1.23

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