RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376510.7

MSRB2-201, Transcript of methionine sulfoxide reductase B2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSRB2, Length 1,803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB2-201ENST00000376510 C3orf58Q8NDZ4 430 aa28.85■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 PAAF1Q9BRP4 392 aa28.85■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 GDF3Q9NR23 364 aa28.85■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 TULP2O00295 520 aa28.84■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 FSCN2O14926 492 aa28.84■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 CAPN15O75808 1086 aa28.84■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 B3GAT3O94766 335 aa28.84■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 TNFRSF8P28908 595 aa28.84■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 CHRNA3P32297 505 aa28.84■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 FAM189BP81408 668 aa28.84■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 ACAP1Q15027 740 aa28.84■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 HADHQ16836 314 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa28.84■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP28.84■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 INPPL1O15357 1258 aa28.83■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 ODC1P11926 461 aa28.83■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP28.83■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 HDXQ7Z353 690 aa28.83■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 METTL23Q86XA0 190 aa28.83■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 RCOR2Q8IZ40 523 aa28.83■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 URGCPQ8TCY9 931 aa28.83■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 CYLDQ9NQC7 956 aa28.83■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 ASNSD1Q9NWL6 643 aa28.83■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 ATP2C2O75185 946 aa28.83■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 RNF8O76064 485 aa28.83■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 ACADSBP45954 432 aa28.83■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 TIGD5Q53EQ6 642 aa28.83■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 PRELID2Q8N945 189 aa28.83■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 RUNDC3BQ96NL0 473 aa28.83■■■□□ 2.21
MSRB2-201ENST00000376510 GPD1P21695 349 aa28.82■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 SLC6A3Q01959 620 aa28.82■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 LINC01599Q8WXQ3 324 aa28.82■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 IFT81Q8WYA0 676 aa28.82■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 MED10Q9BTT4 135 aa28.82■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 PITPNM1O00562 1244 aa28.81■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 KRT1P04264 644 aa28.81■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 DESP17661 470 aa28.81■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 DR1Q01658 176 aa28.81■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa28.81■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 SCUBE3Q8IX30 993 aa28.81■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 HSFY1Q96LI6 401 aa28.81■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 ARHGEF37A1IGU5 675 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 TTI1O43156 1089 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 KRT7P08729 469 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 RARAP10276 462 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 PCSK1P29120 753 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 LLGL1Q15334 1064 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 MDH1BQ5I0G3 518 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 POLNQ7Z5Q5 900 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 SPATA18Q8TC71 538 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 SYT15Q9BQS2 421 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 DUSP16Q9BY84 665 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 FUT8Q9BYC5 575 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 KANSL3Q9P2N6 904 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 DSEQ9UL01 958 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 CDH9Q9ULB4 789 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 MYBL2P10244 700 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 TCF4P15884 667 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 PDGFRAP16234 1089 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 CYP1B1Q16678 543 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 NOMO2Q5JPE7 1267 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 OLFML1Q6UWY5 402 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 CNPY3Q9BT09 278 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 OSBPL8Q9BZF1 889 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 WBP1LQ9NX94 342 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 RASAL2Q9UJF2 1139 aa28.8■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 FAM187AA6NFU0 413 aa28.79■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 NBNO60934 754 aa28.79■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 LRCH4O75427 683 aa28.79■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 RALAP11233 206 aa28.79■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 COL6A1P12109 1028 aa28.79■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 PLA2G4AP47712 749 aa28.79■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 EPHB4P54760 987 aa28.79■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa28.79■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa28.79■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 FUKQ8N0W3 1084 aa28.79■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 RXFP2Q8WXD0 754 aa28.79■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 SEPT8Q92599 483 aa28.79■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 RAB17Q9H0T7 212 aa28.79■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 TMEM161AQ9NX61 479 aa28.79■■■□□ 2.2
MSRB2-201ENST00000376510 ESYT3A0FGR9 886 aa28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms