RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373190.5

PTPRT-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-204ENST00000373190 NNMTP40261 264 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 POU4F1Q01851 419 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 BCS1LQ9Y276 419 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 RGS4P49798 205 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 CACHD1Q5VU97 1274 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 NLGN1Q8N2Q7 840 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 PKP3Q9Y446 797 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 IL12RB1P42701 662 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 TRIM65Q6PJ69 517 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF333Q96JL9 665 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 KRT84Q9NSB2 600 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 SLC24A2Q9UI40 661 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 GTF3C4Q9UKN8 822 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 DUSP10Q9Y6W6 482 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 TCF3P15923 654 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 STIP1P31948 543 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 TRPC7Q9HCX4 862 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 TMEM51Q9NW97 253 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 NEO1Q92859 1461 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 MFN2O95140 757 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 C1DQ13901 141 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 ASZ1Q8WWH4 475 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 RABGEF1Q9UJ41 708 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 MYH7BA7E2Y1 1941 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 TBX3O15119 743 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 DGAT1O75907 488 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 MYBP10242 640 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 GSTT1P30711 240 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 PDPK2PQ6A1A2 396 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 CLEC4GQ6UXB4 293 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 STK39Q9UEW8 545 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 MCM8Q9UJA3 840 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 TGM2P21980 687 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 TALDO1P37837 337 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 HPCAP84074 193 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 GANCQ8TET4 914 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 STK32AQ8WU08 396 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 PNMA3Q9UL41 463 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 MYRFQ9Y2G1 1151 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 TAF4O00268 1085 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 EPHB2P29323 1055 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 FBXO36Q8NEA4 188 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 FEZF2Q8TBJ5 459 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 MROH7Q68CQ1 1323 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 ZSCAN32Q9NX65 697 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 CROCCQ5TZA2 2017 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 FAM205CA6NFA0 338 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 HSMCR30P0CW71 290 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 HERVK_113P62684 666 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 C1orf50Q9BV19 199 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 HMG20AQ9NP66 347 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 FUT11Q495W5 492 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 FBXO40Q9UH90 709 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 FDFT1P37268 417 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF844Q08AG5 666 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 KLHL12Q53G59 568 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 DENND1BQ6P3S1 775 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 FUKQ8N0W3 1084 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 TMEM237Q96Q45 408 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 BDH2Q9BUT1 245 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 BFSP2Q13515 415 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 SPANXN2Q5MJ10 180 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 TRIQKQ629K1 86 aa9.11□□□□□ -0.95
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PTPRT-204ENST00000373190 KLHL31Q9H511 634 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 E9PBE3 544 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 KLHL41O60662 606 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 RAG1P15918 1043 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 NDUFA5Q16718 116 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-204ENST00000373190 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
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