RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 RARAP10276 462 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 TUSC3Q13454 348 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 BFSP2Q13515 415 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 CCDC50Q8IVM0 306 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 ESYT3A0FGR9 886 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 INPPL1O15357 1258 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 PHF2O75151 1096 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 B3GAT3O94766 335 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 CCL5P13501 91 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 CHRNA3P32297 505 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 LHX1P48742 406 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 FAM189BP81408 668 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 HDXQ7Z353 690 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 LINC01599Q8WXQ3 324 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 FTHL17Q9BXU8 183 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 TTI1O43156 1089 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 CARSP49589 748 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 CYP1B1Q16678 543 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 TIGD5Q53EQ6 642 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 OLFML1Q6UWY5 402 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 SCUBE3Q8IX30 993 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 IFT81Q8WYA0 676 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 LRCH4O75427 683 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 GABBR2O75899 941 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 DR1Q01658 176 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 ACAP1Q15027 740 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 GLB1LQ6UWU2 654 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 RCOR2Q8IZ40 523 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 MAIP1Q8WWC4 291 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 UROC1Q96N76 676 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 MAP2K7O14733 419 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 RALAP11233 206 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 SLC6A3Q01959 620 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 TRADDQ15628 312 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 KIAA0319Q5VV43 1072 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 FUKQ8N0W3 1084 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 HERPUD2Q9BSE4 406 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 C2CD4BA6NLJ0 364 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 NBNO60934 754 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 GPD1P21695 349 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 CETN2P41208 172 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 RPL34P49207 117 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 CCDC142Q17RM4 750 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 RXFP2Q8WXD0 754 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 HSFY1Q96LI6 401 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 HEMGNQ9BXL5 484 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 DUSP16Q9BY84 665 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 B3GNT5Q9BYG0 378 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 OSBPL8Q9BZF1 889 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 CYLDQ9NQC7 956 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 KLHL11Q9NVR0 708 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 ASNSD1Q9NWL6 643 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 PCYOX1Q9UHG3 505 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 PI4K2BG5E9Z4 385 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 PITPNM1O00562 1244 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 RRP9O43818 475 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 GRAP2O75791 330 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 CAPN15O75808 1086 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 RNF8O76064 485 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 KRT1P04264 644 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 ODC1P11926 461 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 PDGFRAP16234 1089 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 PAX3P23760 479 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 PLA2G4AP47712 749 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 EPHB4P54760 987 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 SLC8A3P57103 927 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 CASP8Q14790 479 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 GPNMBQ14956 572 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-201ENST00000331803 TAF5Q15542 800 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms