RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329970.7

GTF3C6-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C6, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6-201ENST00000329970 SOX9P48436 509 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 PDE6CP51160 858 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 CDR1P51861 262 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 KRT85P78386 507 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 FOXK2Q01167 660 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 GAS6Q14393 721 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 WDR44Q5JSH3 913 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 SDHAF4Q5VUM1 108 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 TXNDC8Q6A555 127 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 FSIP1Q8NA03 581 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 ZNF516Q92618 1163 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 MYLPFQ96A32 169 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 PAGE5Q96GU1 130 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 ZFYVE19Q96K21 471 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 MMS19Q96T76 1030 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 TTLL2Q9BWV7 592 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 XYLT2Q9H1B5 865 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 CCL26Q9Y258 94 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 PDXKO00764 312 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 EXOC3O60645 756 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 ATP2C2O75185 946 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 HOXA6P31267 233 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 CXCL12P48061 93 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 PPP3CCP48454 512 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 TNNC1P63316 161 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 NOP14P78316 857 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 AMPD2Q01433 879 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 TNK2Q07912 1038 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 STK4Q13043 487 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 USP4Q13107 963 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 RUNX3Q13761 415 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 PDGFRLQ15198 375 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 ZNF77Q15935 545 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 CCDC142Q17RM4 750 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 TSSK4Q6SA08 328 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 STKLD1Q8NE28 680 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 PARD3BQ8TEW8 1205 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 CCDC127Q96BQ5 260 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 PCED1BQ96HM7 432 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 C8orf48Q96LL4 319 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 KCTD10Q9H3F6 313 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 HPS4Q9NQG7 708 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 GKN1Q9NS71 199 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 EXOC1Q9NV70 894 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 GCNT4Q9P109 453 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 EML5Q05BV3 1969 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 DNAH14Q0VDD8 3507 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 USP17L7P0C7H9 530 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 CNR2P34972 360 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 TRPC3Q13507 836 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 PON2Q15165 354 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 NFIL3Q16649 462 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 WDR72Q3MJ13 1102 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 TMEM196Q5HYL7 178 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 ERMP1Q7Z2K6 904 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 SPATA32Q96LK8 384 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 SNX25Q9H3E2 840 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 ZDHHC9Q9Y397 364 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 NME7Q9Y5B8 376 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 A0A1B0GVL5 298 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 K7ESF4 209 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 MAPK13O15264 365 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 RHOBTB3O94955 611 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 KIF20AO95235 890 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 PDGFRBP09619 1106 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 BDNFP23560 247 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 ANXA13P27216 316 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 ID4P47928 161 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 MYL6P60660 151 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 SATB1Q01826 763 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 ENPEPQ07075 957 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 MTF1Q14872 753 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 OR6B3Q8NGW1 331 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 RIN3Q8TB24 985 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 TMC2Q8TDI7 906 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms