RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329151.5

TMEM54-201, Transcript of transmembrane protein 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM54, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54-201ENST00000329151 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 RNF40O75150 1001 aa24.94■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 DLATP10515 647 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 TGM1P22735 817 aa24.94■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 MAGEA11P43364 429 aa24.94■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 FSTL4Q6MZW2 842 aa24.94■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 VSTM1Q6UX27 236 aa24.94■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa24.94■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 CBWD2Q8IUF1 395 aa24.94■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 WDR49Q8IV35 697 aa24.94■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 CCDC26Q8TAB7 109 aa24.94■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 OSCP1Q8WVF1 389 aa24.94■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 GABRDO14764 452 aa24.93■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 PDGFRBP09619 1106 aa24.93■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 HDCP19113 662 aa24.93■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 KCNA4P22459 653 aa24.93■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 PXNP49023 591 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 HS2ST1Q7LGA3 356 aa24.93■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 RDH13Q8NBN7 331 aa24.93■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 LINC00301Q8NCQ3 95 aa24.93■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 OR5B17Q8NGF7 314 aa24.93■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 GAB3Q8WWW8 586 aa24.93■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 MYLPFQ96A32 169 aa24.93■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 CYP2S1Q96SQ9 504 aa24.93■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 ECT2Q9H8V3 914 aa24.93■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 C2orf42Q9NWW7 574 aa24.93■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa24.93■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 HELZP42694 1942 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 GREB1Q4ZG55 1949 aa24.92■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa24.92■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 TRIM66O15016 1216 aa24.92■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 AXIN1O15169 862 aa24.92■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 PPP6R2O75170 966 aa24.92■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 EGFP01133 1207 aa24.92■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 GJA4P35212 333 aa24.92■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 TNNC1P63316 161 aa24.92■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 FAM26FQ5R3K3 315 aa24.92■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 CAMKK1Q8N5S9 505 aa24.92■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 CXorf38Q8TB03 319 aa24.92■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 CD101Q93033 1021 aa24.92■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 HPS3Q969F9 1004 aa24.92■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 ACDQ96AP0 544 aa24.92■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 PKMYT1Q99640 499 aa24.92■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 TRIM9Q9C026 710 aa24.92■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 WNT6Q9Y6F9 365 aa24.92■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 SLC30A4O14863 429 aa24.91■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 HCRTO43612 131 aa24.91■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 ATP2C2O75185 946 aa24.91■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 TADA3O75528 432 aa24.91■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 NFATC1O95644 943 aa24.91■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 BDNFP23560 247 aa24.91■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 GALK1P51570 392 aa24.91■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 CYP2J2P51589 502 aa24.91■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 TRPC3Q13507 836 aa24.91■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 IL31Q6EBC2 164 aa24.91■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 FAM171BQ6P995 826 aa24.91■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa24.91■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa24.91■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 SH3RF2Q8TEC5 729 aa24.91■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 SPATA17Q96L03 361 aa24.91■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 CEP295NLQ96MC4 621 aa24.91■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 BACH2Q9BYV9 841 aa24.91■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 KBTBD4Q9NVX7 518 aa24.91■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 UBE4BO95155 1302 aa24.9■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 CUTAO60888 179 aa24.9■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 ABL1P00519 1130 aa24.9■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 WARSP23381 471 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 USP4Q13107 963 aa24.9■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF77Q15935 545 aa24.9■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 CCDC142Q17RM4 750 aa24.9■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 PKN3Q6P5Z2 889 aa24.9■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 OR6B3Q8NGW1 331 aa24.9■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa24.9■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 CCDC127Q96BQ5 260 aa24.9■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 CHFRQ96EP1 664 aa24.9■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 LOXL4Q96JB6 756 aa24.9■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 MAGEF1Q9HAY2 307 aa24.9■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 PTPRJQ12913 1337 aa24.89■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 PTPRDP23468 1912 aa24.89■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 PHACTR2O75167 634 aa24.89■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 PFKLP17858 780 aa24.89■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 LMO2P25791 158 aa24.89■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 MDH1BQ5I0G3 518 aa24.89■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 NELFCDQ8IXH7 590 aa24.89■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 XXYLT1Q8NBI6 393 aa24.89■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 GLIS3Q8NEA6 775 aa24.89■■□□□ 1.58
TMEM54-201ENST00000329151 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms