RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 PCSK1NQ9UHG2 260 aa24.05■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 NME7Q9Y5B8 376 aa24.05■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 E5RJQ4 531 aa24.04■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa24.04■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 KDELR1P24390 212 aa24.04■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 MIPP30301 263 aa24.04■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 SLCO1A2P46721 670 aa24.04■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 VCPP55072 806 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 SNX17Q15036 470 aa24.04■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 OASLQ15646 514 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 ACOT1Q86TX2 421 aa24.04■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 GJD2Q9UKL4 321 aa24.04■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 RASGRF2O14827 1237 aa24.04■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 ETS1P14921 441 aa24.04■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 PSMC4P43686 418 aa24.04■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 CPT1AP50416 773 aa24.04■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa24.04■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 EFR3BQ9Y2G0 817 aa24.04■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 RNF8O76064 485 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 TTC4O95801 387 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 CD48P09326 243 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 SEC24CP53992 1094 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 DYNLT1P63172 113 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 ACAP1Q15027 740 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 TAF5Q15542 800 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 OR6B2Q6IFH4 312 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 LRRC52Q8N7C0 313 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 CCHCR1Q8TD31 782 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 ADAM7Q9H2U9 754 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 NDUFAB1O14561 156 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 AXLP30530 894 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 ARSEP51690 589 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 STILQ15468 1287 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 TAZQ16635 292 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 KYNUQ16719 465 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 C9orf57Q5W0N0 161 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 TRNP1Q6NT89 227 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 AP5M1Q9H0R1 490 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 USP18Q9UMW8 372 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 TULP2O00295 520 aa24.02■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 ITGAVP06756 1048 aa24.02■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 RGS7P49802 495 aa24.02■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 PLCB3Q01970 1234 aa24.02■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa24.02■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 C17orf99Q6UX52 265 aa24.02■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 TTC30AQ86WT1 665 aa24.02■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 SLC35B2Q8TB61 432 aa24.02■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 TMEM121Q9BTD3 319 aa24.02■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 FAM49BQ9NUQ9 324 aa24.02■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 ASNSD1Q9NWL6 643 aa24.02■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 KLK14Q9P0G3 267 aa24.02■■□□□ 1.44
SNX18-201ENST00000326277 CST8O60676 142 aa24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 AGTP01019 485 aa24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 GPD1P21695 349 aa24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 AUHQ13825 339 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 LONRF1Q17RB8 773 aa24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 PKDCCQ504Y2 493 aa24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 PMF1Q6P1K2 205 aa24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 KCTD6Q8NC69 237 aa24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 NINJ2Q9NZG7 142 aa24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 C2CD4BA6NLJ0 364 aa24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 GPS1Q13098 491 aa24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 SOWAHAQ2M3V2 549 aa24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 BBS12Q6ZW61 710 aa24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 ACTL9Q8TC94 416 aa24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 RXFP2Q8WXD0 754 aa24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 HSPH1Q92598 858 aa24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 PEBP4Q96S96 227 aa24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 CNPY3Q9BT09 278 aa24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 MIS12Q9H081 205 aa24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 RNF39Q9H2S5 420 aa24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 GRAP2O75791 330 aa24■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 PDGFRAP16234 1089 aa24■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 PCK1P35558 622 aa24■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 RGS2P41220 211 aa24■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 RAB6CQ53S08 254 aa24■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 UBXN11Q5T124 520 aa24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms