RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315965.6

CCDC71L-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71 like, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC71L, Length 1,575 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71L-201ENST00000315965 CPB1P15086 417 aa25.4■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 PDE4CQ08493 712 aa25.4■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 PDCLQ13371 301 aa25.4■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC8B1Q6J4K2 584 aa25.4■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC35F5Q8WV83 523 aa25.4■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 C11orf70Q9BRQ4 267 aa25.4■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 THAP2Q9H0W7 228 aa25.4■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 LZTFL1Q9NQ48 299 aa25.4■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 KRT82Q9NSB4 513 aa25.4■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 CYTH4Q9UIA0 394 aa25.4■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 CDY1Q9Y6F8 540 aa25.4■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 A0A0U1RQJ8 604 aa25.39■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 ESPNB1AK53 854 aa25.39■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 AP1G2O75843 785 aa25.39■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 MYBL1P10243 752 aa25.39■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 GPC5P78333 572 aa25.39■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 GPR17Q13304 367 aa25.39■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 RAB30Q15771 203 aa25.39■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa25.39■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 STK32AQ8WU08 396 aa25.39■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 ATRIPQ8WXE1 791 aa25.39■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 ZBP1Q9H171 429 aa25.39■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 MSRAQ9UJ68 235 aa25.39■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa25.39■■□□□ 1.66
CCDC71L-201ENST00000315965 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 ARHGEF15O94989 841 aa25.39■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 CTSAP10619 480 aa25.39■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 ARHGAP25P42331 645 aa25.39■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 ARPP19P56211 112 aa25.39■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 SNX16P57768 344 aa25.39■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 CREMQ03060 361 aa25.39■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 PTPN20Q4JDL3 420 aa25.39■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 LIN9Q5TKA1 542 aa25.39■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 TDHQ8IZJ6 230 aa25.39■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF653Q96CK0 615 aa25.39■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 PBX4Q9BYU1 374 aa25.39■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 MIS12Q9H081 205 aa25.39■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 SYNCQ9H7C4 482 aa25.39■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 BDNFP23560 247 aa25.38■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 DNAJB2P25686 324 aa25.38■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 PBX2P40425 430 aa25.38■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 PLA2G4AP47712 749 aa25.38■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 CDR1P51861 262 aa25.38■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 UBE3AQ05086 875 aa25.38■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 CFAP221Q4G0U5 840 aa25.38■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 PMF1Q6P1K2 205 aa25.38■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 CLEC20AQ6ZU45 233 aa25.38■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 CPXM1Q96SM3 734 aa25.38■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 ST7Q9NRC1 585 aa25.38■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 STRIP2Q9ULQ0 834 aa25.38■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa25.38■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 BTNL10A8MVZ5 291 aa25.37■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 RPL17P18621 184 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 OR1D2P34982 312 aa25.37■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 ERVK-21P61565 698 aa25.37■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 PTP4A2Q12974 167 aa25.37■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 C18orf8Q96DM3 657 aa25.37■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 HSFY1Q96LI6 401 aa25.37■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 CLSTN3Q9BQT9 956 aa25.37■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa25.37■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 ABCB6Q9NP58 842 aa25.37■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 CYLDQ9NQC7 956 aa25.37■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 MTUS1Q9ULD2 1270 aa25.37■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 TULP2O00295 520 aa25.36■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 ACADSBP45954 432 aa25.36■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 MAP3K7CLP57077 242 aa25.36■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 TAP1Q03518 808 aa25.36■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 PTPN14Q15678 1187 aa25.36■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 TMC7Q7Z402 723 aa25.36■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 SPPL3Q8TCT6 385 aa25.36■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 SPPL2BQ8TCT7 592 aa25.36■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 PGLYRP2Q96PD5 576 aa25.36■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 SMOQ99835 787 aa25.36■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC4A5Q9BY07 1137 aa25.36■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa25.36■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 UBXN6Q9BZV1 441 aa25.36■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 FNIP2Q9P278 1114 aa25.36■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 TRIM10Q9UDY6 481 aa25.36■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 GUCA1BQ9UMX6 200 aa25.36■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 DUSP10Q9Y6W6 482 aa25.36■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 NCANO14594 1321 aa25.36■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 MTMR11A4FU01 709 aa25.35■■□□□ 1.65
CCDC71L-201ENST00000315965 LILRB3O75022 631 aa25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms