RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CTU2-201ENST00000312060 PTPN20Q4JDL3 420 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU2-201ENST00000312060 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CTU2-201ENST00000312060 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CTU2-201ENST00000312060 FBXO22Q8NEZ5 403 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU2-201ENST00000312060 ZNF653Q96CK0 615 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU2-201ENST00000312060 ST7Q9NRC1 585 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU2-201ENST00000312060 KRT82Q9NSB4 513 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU2-201ENST00000312060 TULP2O00295 520 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU2-201ENST00000312060 AP1G2O75843 785 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU2-201ENST00000312060 CALB1P05937 261 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU2-201ENST00000312060 URODP06132 367 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU2-201ENST00000312060 CA3P07451 260 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU2-201ENST00000312060 PMF1Q6P1K2 205 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU2-201ENST00000312060 MSANTD4Q8NCY6 345 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU2-201ENST00000312060 ARHGEF26Q96DR7 871 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU2-201ENST00000312060 SMARCD1Q96GM5 515 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU2-201ENST00000312060 CPXM1Q96SM3 734 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU2-201ENST00000312060 C17orf80Q9BSJ5 609 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU2-201ENST00000312060 PLVAPQ9BX97 442 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU2-201ENST00000312060 SYNCQ9H7C4 482 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU2-201ENST00000312060 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
CTU2-201ENST00000312060 CDY1Q9Y6F8 540 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU2-201ENST00000312060 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 BTNL10A8MVZ5 291 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 BEST1O76090 585 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 MYBL1P10243 752 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 CPB1P15086 417 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 BDNFP23560 247 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 RGS7P49802 495 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 LIN9Q5TKA1 542 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 SLC8B1Q6J4K2 584 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 CLEC20AQ6ZU45 233 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 STK32AQ8WU08 396 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 C18orf8Q96DM3 657 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 MYO1AQ9UBC5 1043 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 MACROD2A1Z1Q3 448 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 ARHGEF15O94989 841 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 RRM1P23921 792 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 DNAJB2P25686 324 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 MAP3K7CLP57077 242 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 GPR17Q13304 367 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 RFFLQ8WZ73 363 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 SLC4A5Q9BY07 1137 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 SALL4Q9UJQ4 1053 aa23.38■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 CAPN15O75808 1086 aa23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 RPL17P18621 184 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 BMP8BP34820 402 aa23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 OR1D2P34982 312 aa23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 PLA2G4AP47712 749 aa23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 RGS19P49795 217 aa23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 SMARCB1Q12824 385 aa23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 RHOT2Q8IXI1 618 aa23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 SLC35G2Q8TBE7 412 aa23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 HSFY1Q96LI6 401 aa23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 PGLYRP2Q96PD5 576 aa23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 SMOQ99835 787 aa23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 CLSTN3Q9BQT9 956 aa23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 ZBP1Q9H171 429 aa23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 TJP2Q9UDY2 1190 aa23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 STRIP2Q9ULQ0 834 aa23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa23.37■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 ERBB2P04626 1255 aa23.36■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 CYP1A2P05177 515 aa23.36■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 RB1P06400 928 aa23.36■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 CTSAP10619 480 aa23.36■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 PBX2P40425 430 aa23.36■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 NOP2P46087 812 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 GABRB2P47870 512 aa23.36■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 CACNA2D1P54289 1103 aa23.36■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 SNX16P57768 344 aa23.36■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 CFAP221Q4G0U5 840 aa23.36■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 CYP4A22Q5TCH4 519 aa23.36■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 SPRED2Q7Z698 418 aa23.36■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 TMEM110Q86TL2 294 aa23.36■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 PIGZQ86VD9 579 aa23.36■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 GPR65Q8IYL9 337 aa23.36■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 AUTS2Q8WXX7 1259 aa23.36■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 KCNK16Q96T55 309 aa23.36■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 MIS12Q9H081 205 aa23.36■■□□□ 1.33
CTU2-201ENST00000312060 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms