RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311308.6

TTC9B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC9B, Length 843 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-201ENST00000311308 PON2Q15165 354 aa21.58■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 PDGFRLQ15198 375 aa21.58■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 STKLD1Q8NE28 680 aa21.58■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 OR6B3Q8NGW1 331 aa21.58■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa21.58■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 PAGE5Q96GU1 130 aa21.58■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 SPATA17Q96L03 361 aa21.58■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 SPATA32Q96LK8 384 aa21.58■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 EPC1Q9H2F5 836 aa21.58■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.58■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 ATP2C2O75185 946 aa21.57■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 KIF20AO95235 890 aa21.57■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 STAU1O95793 577 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 CST3P01034 146 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 BDNFP23560 247 aa21.57■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 BIRC3Q13489 604 aa21.57■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 KCNB1Q14721 858 aa21.57■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 TXNDC11Q6PKC3 985 aa21.57■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa21.57■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 KIAA2013Q8IYS2 634 aa21.57■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 FAM83CQ9BQN1 747 aa21.57■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 CRTAC1Q9NQ79 661 aa21.57■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 CCL26Q9Y258 94 aa21.57■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 COL4A2P08572 1712 aa21.57■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 PATJQ8NI35 1801 aa21.57■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 PFKFB1P16118 471 aa21.56■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 SATB1Q01826 763 aa21.56■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC142Q17RM4 750 aa21.56■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa21.56■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 PCED1BQ96HM7 432 aa21.56■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 EBF3Q9H4W6 596 aa21.56■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 GMEB2Q9UKD1 530 aa21.56■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 A0A1B0GVL5 298 aa21.55■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 A8MXQ7 604 aa21.55■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 TADA3O75528 432 aa21.55■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 PFKLP17858 780 aa21.55■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 CCINQ13939 588 aa21.55■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 MTF1Q14872 753 aa21.55■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 KMT5BQ4FZB7 885 aa21.55■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 MDH1BQ5I0G3 518 aa21.55■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 CPA6Q8N4T0 437 aa21.55■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 ELOVL4Q9GZR5 314 aa21.55■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa21.55■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 KLRC4O43908 158 aa21.54■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 TDGF1P13385 188 aa21.54■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 P4HA1P13674 534 aa21.54■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 SYKP43405 635 aa21.54■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 PPP3CCP48454 512 aa21.54■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 IFNAR2P48551 515 aa21.54■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 MYL6P60660 151 aa21.54■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 STK4Q13043 487 aa21.54■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 GAS6Q14393 721 aa21.54■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 TRIM68Q6AZZ1 485 aa21.54■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 SLC9A9Q8IVB4 645 aa21.54■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 TTC16Q8NEE8 873 aa21.54■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 C8orf48Q96LL4 319 aa21.54■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 HPS4Q9NQG7 708 aa21.54■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 FANCMQ8IYD8 2048 aa21.54■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 ATP8B3O60423 1300 aa21.54■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 PDXKO00764 312 aa21.53■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 ATG13O75143 517 aa21.53■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 HDCP19113 662 aa21.53■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 CNR2P34972 360 aa21.53■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 NR1H3Q13133 447 aa21.53■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF699Q32M78 642 aa21.53■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF667Q5HYK9 610 aa21.53■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 Q6ZS52 159 aa21.53■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 ERMP1Q7Z2K6 904 aa21.53■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 DCLK2Q8N568 766 aa21.53■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 KIAA0895Q8NCT3 520 aa21.53■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 PARD3BQ8TEW8 1205 aa21.53■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 TMEM174Q8WUU8 243 aa21.53■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 OSCP1Q8WVF1 389 aa21.53■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF516Q92618 1163 aa21.53■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 ATP2A3Q93084 1043 aa21.53■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.53■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 VRTNQ9H8Y1 702 aa21.53■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa21.53■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 F8VP50 259 aa21.52■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 CALUO43852 315 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 CASP4P49662 377 aa21.52■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 NCOA4Q13772 614 aa21.52■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF77Q15935 545 aa21.52■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 LONP2Q86WA8 852 aa21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms