RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 CD19P15391 556 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-201ENST00000309641 GJA1P17302 382 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-201ENST00000309641 HOXA9P31269 272 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-201ENST00000309641 GRIK1P39086 918 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-201ENST00000309641 ALDH1A3P47895 512 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-201ENST00000309641 MFAP3P55082 362 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-201ENST00000309641 USP46P62068 366 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-201ENST00000309641 TPM4P67936 248 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-201ENST00000309641 SMARCB1Q12824 385 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-201ENST00000309641 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-201ENST00000309641 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-201ENST00000309641 SLC5A9Q2M3M2 681 aa9.65□□□□□ -0.86
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PDE4D-201ENST00000309641 TTC30AQ86WT1 665 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-201ENST00000309641 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-201ENST00000309641 TCEAL4Q96EI5 215 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-201ENST00000309641 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-201ENST00000309641 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-201ENST00000309641 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-201ENST00000309641 CORO1BQ9BR76 489 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-201ENST00000309641 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-201ENST00000309641 PIDD1Q9HB75 910 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-201ENST00000309641 ABCB6Q9NP58 842 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-201ENST00000309641 DPP7Q9UHL4 492 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-201ENST00000309641 MYH10P35580 1976 aa9.65□□□□□ -0.86
PDE4D-201ENST00000309641 FAM170AA1A519 330 aa9.65□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 AP1G2O75843 785 aa9.65□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 RHOP08100 348 aa9.65□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 CLCN1P35523 988 aa9.65□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 PBX1P40424 430 aa9.65□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 MAGEA11P43364 429 aa9.65□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 TUFMP49411 452 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 MAP3K7CLP57077 242 aa9.65□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 ITIH3Q06033 890 aa9.65□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 CES5AQ6NT32 575 aa9.65□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 CLEC20AQ6ZU45 233 aa9.65□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa9.65□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 ITFG1Q8TB96 612 aa9.65□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 JAKMIP2Q96AA8 810 aa9.65□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 LRRC3Q9BY71 257 aa9.65□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 HSFX1Q9UBD0 423 aa9.65□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 MAFFQ9ULX9 164 aa9.65□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 F8VZ95 297 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 O00370 1275 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 BMP1P13497 986 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 PLCB2Q00722 1185 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 FILIP1LQ4L180 1135 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 ATAT1Q5SQI0 421 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 SLC47A2Q86VL8 602 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 TMC8Q8IU68 726 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 FAM71AQ8IYT1 594 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 TTC39CQ8N584 583 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 NEK11Q8NG66 645 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 SCAMP5Q8TAC9 235 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 UBA3Q8TBC4 463 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 PSMG2Q969U7 264 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 SMARCD1Q96GM5 515 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 ASB2Q96Q27 587 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 TSPAN16Q9UKR8 245 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 TTC28Q96AY4 2481 aa9.64□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 SLC38A8A6NNN8 435 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 HHLA1C9JL84 531 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 XYLBO75191 536 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 MOSPD3O75425 235 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 PAEPP09466 180 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 MYL4P12829 197 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 EPHB3P54753 998 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 JAM2P57087 298 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
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PDE4D-201ENST00000309641 PLD1Q13393 1074 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 GREB1Q4ZG55 1949 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 SGO2Q562F6 1265 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 STXBP5Q5T5C0 1151 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 ARHGAP17Q68EM7 881 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 VSTM1Q6UX27 236 aa9.63□□□□□ -0.87
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PDE4D-201ENST00000309641 TMEM150AQ86TG1 271 aa9.63□□□□□ -0.87
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PDE4D-201ENST00000309641 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 ING5Q8WYH8 240 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 STK33Q9BYT3 514 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 IL21Q9HBE4 155 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 CLUHO75153 1309 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-201ENST00000309641 A0A1W2PQC6 194 aa9.63□□□□□ -0.87
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