RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298307.9

KLHDC2-201, Transcript of kelch domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KLHDC2, Length 5,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2-201ENST00000298307 APOPT1Q96IL0 206 aa20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 SIK2Q9H0K1 926 aa20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 NYAP2Q9P242 653 aa20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 SLC13A4Q9UKG4 626 aa20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 TBC1D12O60347 775 aa20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 PRKCBP05771 671 aa20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 RIT2Q99578 217 aa20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 NIF3L1Q9GZT8 377 aa20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 DNAJC18Q9H819 358 aa20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 KCNT1Q5JUK3 1230 aa20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 CCDC81Q6ZN84 652 aa20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 PNMA5Q96PV4 448 aa20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 FAM8A1Q9UBU6 413 aa20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 DEPDC5O75140 1603 aa20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 EPHB6O15197 1021 aa20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 KCNK10P57789 538 aa20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 STILQ15468 1287 aa20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 FLAD1Q8NFF5 587 aa20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 FAM81AQ8TBF8 368 aa20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 KAT2BQ92831 832 aa20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 GORASP1Q9BQQ3 440 aa20.61■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 KRT36O76013 467 aa20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 SEL1L3Q68CR1 1132 aa20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 RNF149Q8NC42 400 aa20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 TBX20Q9UMR3 447 aa20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 ZNF839A8K0R7 811 aa20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 KCTD21Q4G0X4 260 aa20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 POU5F2Q8N7G0 328 aa20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 MYO1GB0I1T2 1018 aa20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 PSMD3O43242 534 aa20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 KYQ8NBH2 561 aa20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 SGF29Q96ES7 293 aa20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 KIF12Q96FN5 646 aa20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 EPAS1Q99814 870 aa20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 ALADP13716 330 aa20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 ZNF23P17027 643 aa20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 PTK6Q13882 451 aa20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 PDK1Q15118 436 aa20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa20.6■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 XKR3Q5GH77 459 aa20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 WDR60Q8WVS4 1066 aa20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 AGAP1Q9UPQ3 857 aa20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 GRIP2Q9C0E4 1043 aa20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 SSTR1P30872 391 aa20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 RIPK1Q13546 671 aa20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 PYDC1Q8WXC3 89 aa20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 TMEM247A6NEH6 219 aa20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 FAM162AQ96A26 154 aa20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa20.59■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 NFKBIAP25963 317 aa20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 SLC35C1Q96A29 364 aa20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 GCNAQ96QF7 691 aa20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 SP110Q9HB58 689 aa20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 DPP9Q86TI2 863 aa20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 USP33Q8TEY7 942 aa20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 APBB2Q92870 758 aa20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 TLR2O60603 784 aa20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 CNTFP26441 200 aa20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 AADACL2Q6P093 401 aa20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
KLHDC2-201ENST00000298307 AFF2P51816 1311 aa20.58■□□□□ 0.88
KLHDC2-201ENST00000298307 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa20.58■□□□□ 0.88
KLHDC2-201ENST00000298307 HSD17B4P51659 736 aa20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms