RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293695.7

SYCE2-201, Transcript of synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYCE2, Length 1,231 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2-201ENST00000293695 TNK2Q07912 1038 aa15.4■□□□□ 0.06
SYCE2-201ENST00000293695 KMT5BQ4FZB7 885 aa15.4■□□□□ 0.06
SYCE2-201ENST00000293695 OR6B3Q8NGW1 331 aa15.4■□□□□ 0.06
SYCE2-201ENST00000293695 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
SYCE2-201ENST00000293695 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
SYCE2-201ENST00000293695 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
SYCE2-201ENST00000293695 CEP295NLQ96MC4 621 aa15.4■□□□□ 0.06
SYCE2-201ENST00000293695 CRTAC1Q9NQ79 661 aa15.4■□□□□ 0.06
SYCE2-201ENST00000293695 GKN1Q9NS71 199 aa15.4■□□□□ 0.06
SYCE2-201ENST00000293695 EHD2Q9NZN4 543 aa15.4■□□□□ 0.06
SYCE2-201ENST00000293695 CCL26Q9Y258 94 aa15.4■□□□□ 0.06
SYCE2-201ENST00000293695 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa15.4■□□□□ 0.06
SYCE2-201ENST00000293695 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 TRIM66O15016 1216 aa15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 KLRC4O43908 158 aa15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 CKMP06732 381 aa15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 FAM163BP0C2L3 166 aa15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 USP17L7P0C7H9 530 aa15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 BDNFP23560 247 aa15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 CXCL12P48061 93 aa15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 AP3M2P53677 418 aa15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 AMPD2Q01433 879 aa15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 STK4Q13043 487 aa15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 BIRC3Q13489 604 aa15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 PON2Q15165 354 aa15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 TXNDC11Q6PKC3 985 aa15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 SPEM1Q8N4L4 309 aa15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 SUMF1Q8NBK3 374 aa15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 KIAA0895Q8NCT3 520 aa15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 NELL1Q92832 810 aa15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 PCED1BQ96HM7 432 aa15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 SPATA17Q96L03 361 aa15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 NCDNQ9UBB6 729 aa15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.39■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 LILRB5O75023 590 aa15.38■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 TADA3O75528 432 aa15.38■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 KIF20AO95235 890 aa15.38■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 STAU1O95793 577 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 SYKP43405 635 aa15.38■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 PDE6CP51160 858 aa15.38■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 MYL6P60660 151 aa15.38■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 FAM160A1Q05DH4 1040 aa15.38■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 RUNX3Q13761 415 aa15.38■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 KCNB1Q14721 858 aa15.38■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 MDH1BQ5I0G3 518 aa15.38■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa15.38■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 TTC16Q8NEE8 873 aa15.38■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 ZNF516Q92618 1163 aa15.38■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 FAM83CQ9BQN1 747 aa15.38■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 EBF3Q9H4W6 596 aa15.38■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 A8MXQ7 604 aa15.37■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 PDXKO00764 312 aa15.37■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 CASP4P49662 377 aa15.37■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 SATB1Q01826 763 aa15.37■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 MTF1Q14872 753 aa15.37■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 PDGFRLQ15198 375 aa15.37■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 ZNF699Q32M78 642 aa15.37■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 ZNF667Q5HYK9 610 aa15.37■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 TRIM68Q6AZZ1 485 aa15.37■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 SLC9A9Q8IVB4 645 aa15.37■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 KIAA2013Q8IYS2 634 aa15.37■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 SYNPOQ8N3V7 929 aa15.37■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 PARD3BQ8TEW8 1205 aa15.37■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 EXOC4Q96A65 974 aa15.37■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 ELOVL4Q9GZR5 314 aa15.37■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 EPC1Q9H2F5 836 aa15.37■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 HPS4Q9NQG7 708 aa15.37■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 RAB23Q9ULC3 237 aa15.37■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 HPSEQ9Y251 543 aa15.37■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 SPAG17Q6Q759 2223 aa15.37■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 GPR179Q6PRD1 2367 aa15.36■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 DMXL1Q9Y485 3027 aa15.36■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 MYO16Q9Y6X6 1858 aa15.36■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 F8VP50 259 aa15.36■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 CALUO43852 315 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 NR3C1P04150 777 aa15.36■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 RPN1P04843 607 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 HDCP19113 662 aa15.36■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 ID4P47928 161 aa15.36■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 IFNAR2P48551 515 aa15.36■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP15.36■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 NCOA4Q13772 614 aa15.36■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 CCINQ13939 588 aa15.36■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 GAS6Q14393 721 aa15.36■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 CEP135Q66GS9 1140 aa15.36■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 Q6ZS52 159 aa15.36■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 CPA6Q8N4T0 437 aa15.36■□□□□ 0.05
SYCE2-201ENST00000293695 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms