RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 FAM155BO75949 473 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF24P17028 368 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 GAP43P17677 238 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 PAX3P23760 479 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 NFKBIAP25963 317 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 COPAP53621 1224 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TAS2R40P59535 323 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ATG16L1Q676U5 607 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM53Q6P2H8 277 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TMC7Q7Z402 723 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 NEDD1Q8NHV4 660 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 CBWD1Q9BRT8 395 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 DMTF1Q9Y222 760 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 HEY1Q9Y5J3 304 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 AKR1B1P15121 316 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 RPA1P27694 616 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 PRAMEP78395 509 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF568Q3ZCX4 644 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 MIER3Q7Z3K6 550 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 THAP11Q96EK4 314 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 NT5C1BQ96P26 610 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 E2F8A0AVK6 867 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 AIM2O14862 343 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 BUD23O43709 281 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 DGKIO75912 1065 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 VARSP26640 1264 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 NRF1Q16656 503 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 C6orf183Q5T699 404 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 LIN9Q5TKA1 542 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 METTL25Q8N6Q8 603 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 SERAC1Q96JX3 654 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 CORO1BQ9BR76 489 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 UNC45AQ9H3U1 944 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TNFAIP8O95379 198 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 FAM58BPP0C7Q3 252 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 MAPK10P53779 464 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ASPRV1Q53RT3 343 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ACAD10Q6JQN1 1059 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 DCUN1D2Q6PH85 259 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC80Q76M96 950 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 POLNQ7Z5Q5 900 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 OLIG1Q8TAK6 271 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 OLFML3Q9NRN5 406 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TBC1D23Q9NUY8 699 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TLR3O15455 904 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 CYP1A2P05177 515 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 LDHCP07864 332 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 GZMAP12544 262 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 SLC5A2P31639 672 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 GTF2H1P32780 548 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 GRIK5Q16478 980 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 SMYD1Q8NB12 490 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 FNDC8Q8TC99 324 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 MMP19Q99542 508 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 SYT11Q9BT88 431 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 KCPQ6ZWJ8 1503 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TJP1Q07157 1748 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF804BA4D1E1 1349 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 C6orf229H3BNL8 230 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 SPTLC1O15269 473 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 OCM2P0CE71 109 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 FDX1P10109 184 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 HOXD12P35452 270 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 GPX6P59796 221 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 STX3Q13277 289 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 BANPQ8N9N5 519 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 CASP10Q92851 521 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 MAML3Q96JK9 1138 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 RIOX1Q9H6W3 641 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 GPAMQ9HCL2 828 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGEF4Q9NR80 690 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 EML1O00423 815 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms