RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 VAT1Q99536 393 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 UBXN6Q9BZV1 441 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 CCT8L1PA6NM43 557 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 IFNA14P01570 189 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 PTGER2P43116 358 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 UCMAQ8WVF2 138 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 SOCS4Q8WXH5 440 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 SEC16BQ96JE7 1060 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 CCT8L2Q96SF2 557 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 SYTL2Q9HCH5 934 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 PDP2Q9P2J9 529 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 STK39Q9UEW8 545 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 DNPEPQ9ULA0 475 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 SHOC2Q9UQ13 582 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 DISP2A7MBM2 1401 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 SDR42E2A6NKP2 422 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 DTNBO60941 627 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 CRTAMO95727 393 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 THRAP10827 490 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 FGFR4P22455 802 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 DSG3P32926 999 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 NPY2RP49146 381 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 PTGISQ16647 500 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 CCL15Q16663 113 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 KYNUQ16719 465 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 FAM47EQ6ZV65 393 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 BBS7Q8IWZ6 715 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 ARRDC4Q8NCT1 418 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 SLC25A13Q9UJS0 675 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 A0A087WWV3 80 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 CABYRO75952 493 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 APOA1P02647 267 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 VCLP18206 1134 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 ADCY1Q08828 1119 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC153Q494R4 210 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 CACHD1Q5VU97 1274 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 SPATA18Q8TC71 538 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 TADA1Q96BN2 335 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 TMBIM4Q9HC24 238 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF839A8K0R7 811 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 INHBEP58166 350 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 NFIAQ12857 509 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 ENOPH1Q9UHY7 261 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 NAGPAQ9UK23 515 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 RICTORQ6R327 1708 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 RAD23BP54727 409 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 FLOT2Q14254 428 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 RRM2BQ7LG56 351 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF720Q7Z2F6 126 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 REXO1L1PQ8IX06 675 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM86AQ8N2M4 240 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 CPVLQ9H3G5 476 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 PCDH9Q9HC56 1237 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 CASS4Q9NQ75 786 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 GGA3Q9NZ52 723 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 TBC1D12O60347 775 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 TP53BP2Q13625 1128 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 TAAR1Q96RJ0 339 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 TASP1Q9H6P5 420 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 F5H5T6 163 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 PLSCR1O15162 318 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 KCNQ2O43526 872 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 SPANXN3Q5MJ09 141 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 GRTP1Q5TC63 336 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 PKN3Q6P5Z2 889 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 LONP2Q86WA8 852 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 LRRC39Q96DD0 335 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 SPON2Q9BUD6 331 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 DEFB129Q9H1M3 183 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 SCN3BQ9NY72 215 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 BCL9LQ86UU0 1499 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 MAN1A2O60476 641 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 SARSP49591 514 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 C16orf87Q6PH81 154 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 MKL1Q969V6 931 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 CHP1Q99653 195 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRB-201ENST00000261266 MUC3BQ9H195 1237 aa9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms