RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.38■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 ASAH2Q9NR71 780 aa22.38■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.38■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 TAB2Q9NYJ8 693 aa22.38■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 ASB3Q9Y575 518 aa22.38■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 MYO10Q9HD67 2058 aa22.38■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 PATJQ8NI35 1801 aa22.38■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 MOSPD3O75425 235 aa22.37■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 MYL4P12829 197 aa22.37■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 CEBPBP17676 345 aa22.37■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 SLC9A1P19634 815 aa22.37■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 APBA1Q02410 837 aa22.37■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 MTMR3Q13615 1198 aa22.37■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 VEPH1Q14D04 833 aa22.37■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.37■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa22.37■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.37■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 VSTM1Q6UX27 236 aa22.37■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 GBP6Q6ZN66 633 aa22.37■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 OTOP3Q7RTS5 596 aa22.37■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 FUKQ8N0W3 1084 aa22.37■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.37■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 PRRX2Q99811 253 aa22.37■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.37■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 NDST4Q9H3R1 872 aa22.37■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.37■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 TECTAO75443 2155 aa22.37■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 TRIOO75962 3097 aa22.37■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 GJA1P17302 382 aa22.36■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 RAD23BP54727 409 aa22.36■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 KRT31Q15323 416 aa22.36■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 IER5LQ5T953 404 aa22.36■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 RRAGAQ7L523 313 aa22.36■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 ITIH5Q86UX2 942 aa22.36■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.36■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 UBALD2Q8IYN6 164 aa22.36■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.36■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.36■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 SLC2A14Q8TDB8 520 aa22.36■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 FGF13Q92913 245 aa22.36■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 KREMEN1Q96MU8 473 aa22.36■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 SLC38A8A6NNN8 435 aa22.35■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 F8VP50 259 aa22.35■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 ZNF18P17022 549 aa22.35■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 GRIK1P39086 918 aa22.35■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.35■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 GJB7Q6PEY0 223 aa22.35■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 GAREM2Q75VX8 874 aa22.35■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 TTC39CQ8N584 583 aa22.35■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 SHKBP1Q8TBC3 707 aa22.35■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 MED10Q9BTT4 135 aa22.35■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 IL21Q9HBE4 155 aa22.35■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 EPS15L1Q9UBC2 864 aa22.35■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.35■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 CDH7Q9ULB5 785 aa22.35■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 MUC6Q6W4X9 2439 aa22.35■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 NOL4O94818 638 aa22.34■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 PON1P27169 355 aa22.34■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 ADORA2BP29275 332 aa22.34■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 GCNT1Q02742 428 aa22.34■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.34■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 LEMD2Q8NC56 503 aa22.34■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.34■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 SIX2Q9NPC8 291 aa22.34■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 KRT82Q9NSB4 513 aa22.34■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 ATP8B3O60423 1300 aa22.33■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa22.33■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 A0A1W2PRU2 124 aa22.33■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 ZNF197O14709 1029 aa22.33■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 CSH1P0DML2 217 aa22.33■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 CSH2P0DML3 217 aa22.33■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 LAMP2P13473 410 aa22.33■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 GABRR2P28476 465 aa22.33■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 AVPR2P30518 371 aa22.33■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 ZNF165P49910 485 aa22.33■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 MRE11P49959 708 aa22.33■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 ZMIZ2Q8NF64 920 aa22.33■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 PRSS33Q8NF86 280 aa22.33■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 SMARCD1Q96GM5 515 aa22.33■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 SPATA17Q96L03 361 aa22.33■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 C8orf48Q96LL4 319 aa22.33■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 KCNK16Q96T55 309 aa22.33■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 SMOQ99835 787 aa22.33■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 VPS16Q9H269 839 aa22.33■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
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