RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227667.7

APOC3-201, Transcript of apolipoprotein C3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOC3, Length 550 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3-201ENST00000227667 SPACA7Q96KW9 195 aa11.7□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 GSDMAQ96QA5 445 aa11.7□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 FNBP1Q96RU3 617 aa11.7□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 HSD17B14Q9BPX1 270 aa11.7□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 CCDC113Q9H0I3 377 aa11.7□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 PILRBQ9UKJ0 227 aa11.7□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 TBX20Q9UMR3 447 aa11.7□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 PCDHB8Q9UN66 801 aa11.7□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 CCL26Q9Y258 94 aa11.7□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 RAI2Q9Y5P3 530 aa11.7□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 EML5Q05BV3 1969 aa11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 ALDH1A2O94788 518 aa11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 ITPKAP23677 461 aa11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 CASP1P29466 404 aa11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 CDC25CP30307 473 aa11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 ZNF165P49910 485 aa11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 CUL4BQ13620 913 aa11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 PDGFRLQ15198 375 aa11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 TAF12Q16514 161 aa11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 DUOXA1Q1HG43 343 aa11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 C2orf27AQ580R0 203 aa11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 XKR4Q5GH76 650 aa11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 KRT79Q5XKE5 535 aa11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 KCNK18Q7Z418 384 aa11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 USP37Q86T82 979 aa11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 CPA6Q8N4T0 437 aa11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 FRMD1Q8N878 549 aa11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 CEP120Q8N960 986 aa11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 ATAD1Q8NBU5 361 aa11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 OR2I1PQ8NGU4 316 aa11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 SNX29Q8TEQ0 813 aa11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 SMARCE1Q969G3 411 aa11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 CALML4Q96GE6 196 aa11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 STK17AQ9UEE5 414 aa11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 STK24Q9Y6E0 443 aa11.69□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 ZNF462Q96JM2 2506 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 A0A087WV48 116 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 OR6C75A6NL08 312 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 BIN1O00499 593 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 KLRC4O43908 158 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 MED24O75448 989 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 OAZ2O95190 189 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 SMC2O95347 1197 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 SERPINF2P08697 491 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 KCNE1P15382 129 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 RPA1P27694 616 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 HOXD12P35452 270 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 P2RY2P41231 377 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 GRM5P41594 1212 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 AFMP43652 599 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 SEC13P55735 322 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 VEPH1Q14D04 833 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 CRY1Q16526 586 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 SPDYCQ5MJ68 293 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 CCDC33Q8N5R6 958 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 KCTD17Q8N5Z5 321 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 TTC9BQ8N6N2 239 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 MAB21L3Q8N8X9 362 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 TTC16Q8NEE8 873 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 OLIG1Q8TAK6 271 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 USP33Q8TEY7 942 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 BSNDQ8WZ55 320 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 NACC1Q96RE7 527 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 C7orf25Q9BPX7 421 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 LPIN3Q9BQK8 851 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 ECT2Q9H8V3 914 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 TDP1Q9NUW8 608 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 DKK4Q9UBT3 224 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 ZMYM5Q9UJ78 669 aa11.68□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 ATG2BQ96BY7 2078 aa11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 MTMR11A4FU01 709 aa11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 ARHGAP33O14559 1287 aa11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 AP5Z1O43299 807 aa11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 MUTP22033 750 aa11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 NAMPTP43490 491 aa11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 EFNA5P52803 228 aa11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 CYP4F3Q08477 520 aa11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 SLC14A1Q13336 389 aa11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 KCNB1Q14721 858 aa11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 NCAPHQ15003 741 aa11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 LUZP1Q86V48 1076 aa11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 CATSPER3Q86XQ3 398 aa11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 MLKLQ8NB16 471 aa11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 WHAMMQ8TF30 809 aa11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 RAD54LQ92698 747 aa11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 PDLIM2Q96JY6 352 aa11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 ACAP3Q96P50 834 aa11.67□□□□□ -0.54
APOC3-201ENST00000227667 PLIN2Q99541 437 aa11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms