RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 GPR182O15218 404 aa25.2■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 SPTLC1O15269 473 aa25.2■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 PDGFRBP09619 1106 aa25.2■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 KRT10P13645 584 aa25.2■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 THPOP40225 353 aa25.2■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 PTGISQ16647 500 aa25.2■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 TFDP3Q5H9I0 405 aa25.2■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa25.2■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 TTC30AQ86WT1 665 aa25.2■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 ZFP42Q96MM3 310 aa25.2■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 DPEP3Q9H4B8 488 aa25.2■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC38A7Q9NVC3 462 aa25.2■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 NME7Q9Y5B8 376 aa25.2■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 KRT14P02533 472 aa25.19■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 ARHGAP17Q68EM7 881 aa25.19■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 ZDHHC24Q6UX98 284 aa25.19■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa25.19■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 RPAINQ86UA6 219 aa25.19■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 KLHDC9Q8NEP7 349 aa25.19■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa25.19■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 RAPGEF5Q92565 580 aa25.19■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 EXOC4Q96A65 974 aa25.19■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 CAPNS2Q96L46 248 aa25.19■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM129AQ9BZQ8 928 aa25.19■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa25.19■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 GPD1P21695 349 aa25.19■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 LRIG3Q6UXM1 1119 aa25.19■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 GOLGA6L10A6NI86 522 aa25.18■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 PTGESO14684 152 aa25.18■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 LRPAP1P30533 357 aa25.18■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 PTPN7P35236 360 aa25.18■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 LILRA4P59901 499 aa25.18■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 CAP1Q01518 475 aa25.18■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 SMTNL2Q2TAL5 461 aa25.18■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 DEFB115Q30KQ5 88 aa25.18■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 PKDCCQ504Y2 493 aa25.18■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 PMF1Q6P1K2 205 aa25.18■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 ADGRF2Q8IZF7 708 aa25.18■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM118BQ9BPY3 351 aa25.18■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 PPFIA2O75334 1257 aa25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 FGFR1P11362 822 aa25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 CST5P28325 142 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 HOXD10P28358 340 aa25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 MLH1P40692 756 aa25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 LMNB2Q03252 620 aa25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 PTK6Q13882 451 aa25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF365Q70YC5 407 aa25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 CRYBG2Q8N1P7 616 aa25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM76AQ8TAV0 307 aa25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 TNIP3Q96KP6 325 aa25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 NOD1Q9Y239 953 aa25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 PDGFRAP16234 1089 aa25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 ADORA2BP29275 332 aa25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 CDKN2BP42772 138 aa25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 PDE4CQ08493 712 aa25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 MGAT3Q09327 533 aa25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 GSTA5Q7RTV2 222 aa25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 TOP6BLQ8N6T0 577 aa25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC35F5Q8WV83 523 aa25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 CNPY3Q9BT09 278 aa25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC4A5Q9BY07 1137 aa25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 WHRNQ9P202 907 aa25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 PCSK1NQ9UHG2 260 aa25.17■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 TULP2O00295 520 aa25.16■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 HCRTO43612 131 aa25.16■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC130P13994 396 aa25.16■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 DESP17661 470 aa25.16■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 LMO2P25791 158 aa25.16■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 BCAT1P54687 386 aa25.16■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 KCNT1Q5JUK3 1230 aa25.16■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 SPDYCQ5MJ68 293 aa25.16■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 CEP85LQ5SZL2 805 aa25.16■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF618Q5T7W0 954 aa25.16■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 STK32AQ8WU08 396 aa25.16■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 ART4Q93070 314 aa25.16■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 SNF8Q96H20 258 aa25.16■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 SRRDQ9UH36 339 aa25.16■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 DNAH12Q6ZR08 3092 aa25.16■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 ATF2P15336 505 aa25.16■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 IL1R2P27930 398 aa25.16■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 BST2Q10589 180 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 RNF180Q86T96 592 aa25.16■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 RXFP2Q8WXD0 754 aa25.16■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 GAD1Q99259 594 aa25.16■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 LPIN3Q9BQK8 851 aa25.16■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 C2CD4BA6NLJ0 364 aa25.15■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 MEIS3P2A8K0S8 358 aa25.15■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 GRAP2O75791 330 aa25.15■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 THP07101 528 aa25.15■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 ITIH2P19823 946 aa25.15■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 MIPP30301 263 aa25.15■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 PMS2P54278 862 aa25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms