RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025667.12

Rtn3-201, Transcript of Reticulon-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rtn3, Length 2,841 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Rps6kl1Q8R2S1 544 aa16.64■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Brd8Q8R3B7 951 aa16.64■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Ppp2r2dQ925E7 453 aa16.64■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Cyp4f15Q99N18 534 aa16.64■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Wdr83Q9DAJ4 315 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 PolhQ9JJN0 694 aa16.64■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 HephQ9Z0Z4 1157 aa16.64■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Col4a1P02463 1669 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Krt83E9Q1Y9 479 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 1600015I10RikE9Q745 711 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Cbfa2t2O70374 594 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Foxp2P58463 714 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Rhbdl3P58873 404 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Fut11Q8BHC9 489 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Clasp2Q8BRT1 1286 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Trim14Q8BVW3 440 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 VcpkmtQ8C436 228 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 RtknQ8C6B2 564 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Cfap36Q8C6E0 343 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Rab15Q8K386 212 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Olfr1502Q8VG66 316 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Mapk8Q91Y86 384 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Rnf31Q924T7 1066 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Dach2Q925Q8 634 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Gtf2ird2Q99NI3 936 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Taf7lQ9D3R9 471 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Adam22Q9R1V6 904 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Sucla2Q9Z2I9 463 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Tsc22d3Q9Z2S7 137 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 PtproE9Q612 1226 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 FxnO35943 207 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Hace1Q3U0D9 909 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Sox11Q7M6Y2 395 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Clca2Q8BG22 942 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Creb5Q8K1L0 357 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 St5Q924W7 1134 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Dhrs7Q9CXR1 338 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Clvs1Q9D4C9 354 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Slc13a2Q9ES88 586 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Ggt5Q9Z2A9 573 aa16.63■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Gm13084A2A8N0 494 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Gm3173A6NAS3 172 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Gm3020E9Q3J7 150 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Apol10bG3X9K7 334 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Gm2897K7N6T7 172 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Anxa8O35640 327 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Tlr8P58682 1032 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Slc24a2Q14BI1 711 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Q5EBG8 199 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Fam204aQ8C6C7 236 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Gm3411Q8C7R2 150 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Agbl2Q8CDK2 862 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Acvr1cQ8K348 493 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 TgdsQ8VDR7 355 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Lrrc49Q91YK0 686 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Ddah1Q9CWS0 285 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Prorsd1Q9D820 169 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Sf3b1Q99NB9 1304 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Znf804aA2AKY4 1200 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Prss40A6H6T1 365 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Gm5795E9PZN8 263 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Gm3488M0QW81 238 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Akap3O88987 864 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Atp13a5Q3TYU2 1216 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Sec31bQ3TZ89 1158 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 CamkvQ3UHL1 512 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Tbc1d9bQ5SVR0 1263 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Serpina3fQ80X76 445 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Lmbrd1Q8K0B2 537 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 FggQ8VCM7 436 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Get4Q9D1H7 327 aa16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Fxr2Q9WVR4 673 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 DgkkE9Q7N4 1118 aa16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Pcsk6F6XJP7 959 aa16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 H2-M9O19442 342 aa16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Srpk1O70551 648 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Hoxc11P31313 304 aa16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Epb41P48193 858 aa16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Siah1aP61092 282 aa16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Nsun7Q14AW5 724 aa16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 4930502E18RikQ14BQ3 236 aa16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Gstt1Q64471 240 aa16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Slc38a7Q8BWH0 463 aa16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Irak3Q8K4B2 609 aa16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 OscarQ8VBT3 265 aa16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Sf3b3Q921M3 1217 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Psmd12Q9D8W5 456 aa16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Hcar2Q9EP66 360 aa16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Znf704Q9ERQ3 566 aa16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Shcbp1Q9Z179 668 aa16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Tns2Q8CGB6 1400 aa16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Olfr625-ps1A0A140T8L4 321 aa16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 GabreA2AMW3 916 aa16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Lrrc32G3XA59 663 aa16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 IkbkgO88522 412 aa16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Aldh2P47738 519 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 SftpbP50405 377 aa16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Psmc1P62192 440 aa16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 BmxP97504 651 aa16.61■□□□□ 0.25
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Hk3Q3TRM8 922 aa16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.9 ms