RNA–Protein interactions for RNA: YPR172W

YPR172W, Transcript of Putative pyridoxal 5'-phosphate synthase, yeast

Gene YPR172W, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPR172W	YPR172W	LAA1	P39526	2014 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	NMT1	P14743	455 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	FUN14	P18411	198 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	ANB1	P19211	157 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	YDR366C	P87287	132 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	RAF1	Q06891	181 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	NAT5	Q08689	176 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	YLR157W-E	P0CF00	54 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	YHR213W	P0CI67	198 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	BRP1	P53194	125 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	COA4	Q05809	96 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	SPC3	Q12133	184 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	RTC6	O14464	93 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	SFT2	P38166	215 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	HPM1	P40481	377 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	YPL067C	Q02754	198 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	YMR321C	Q04898	105 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	QCR10	P37299	77 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	YAP3	P38749	330 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	SPG1	P50088	95 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	HHO1	P53551	258 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	FIT3	Q08907	204 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YPR172W	YPR172W	PFY1	P07274	126 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	MRPL44	P19956	98 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	YCR050C	P25630	102 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	YAL064W	P39711	94 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	EMC4	P53073	190 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	YGL149W	P53116	101 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	YGR039W	P53225	103 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	YLR296W	Q05898	108 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	TY4B-J	P47024	1803 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	YBR013C	P38215	129 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	AIM18	P38884	321 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	MIC27	P50945	234 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	GTT2	Q12390	233 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	MED11	Q99278	115 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	PAU21	P0CE86	164 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	PAU22	P0CE87	164 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	ELC1	Q03071	99 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	SDH7	Q04401	133 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	TVP18	Q04767	167 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	HAP3	P13434	144 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	CYC2	P38909	366 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	ATP14	Q12349	124 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	SNT2	P53127	1403 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	TY1B-H	O13535	1793 aa		0.34	□□□□□ -2.35
YPR172W	YPR172W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	HSP10	P38910	106 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	PHS1	P40857	217 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	CSN9	Q03981	162 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	YLR194C	Q05777	254 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	HYM1	P32464	399 aa		0.33	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	LDB18	Q07887	179 aa		0.33	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	YIL163C	P40448	117 aa		0.32	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	GAT4	P40569	121 aa		0.32	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	SFT1	P43682	97 aa		0.32	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	YGR017W	P53210	297 aa		0.32	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	TIM8	P57744	87 aa		0.32	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		0.32	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	SNF2	P22082	1703 aa		0.31	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	YDR278C	Q05612	105 aa		0.31	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	BNI1	P41832	1953 aa		0.3	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	0.3	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	POR2	P40478	281 aa		0.3	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	YGL204C	P53089	101 aa		0.3	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	0.3	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		0.3	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	TRM732	Q03496	1420 aa		0.3	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	NUM1	Q00402	2748 aa		0.29	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	0.29	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	ERV14	P53173	138 aa		0.29	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	SEC59	P20048	519 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	AUA1	P32450	94 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	SRX1	P36077	127 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
YPR172W	YPR172W	YJR128W	P47162	119 aa		0.28	□□□□□ -2.36

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