RNA–Protein interactions for RNA: YMR068W

AVO2, Transcript of Component of a complex containing the Tor2p kinase and other proteins, yeast

Gene AVO2, Length 1,281 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AVO2	YMR068W	YIP3	P53633	176 aa		4.28	□□□□□ -1.72
AVO2	YMR068W	SNO1	Q03144	224 aa		4.28	□□□□□ -1.72
AVO2	YMR068W	YMR252C	Q04814	134 aa		4.28	□□□□□ -1.72
AVO2	YMR068W	SPC2	Q04969	178 aa		4.28	□□□□□ -1.72
AVO2	YMR068W	CDC7	P06243	507 aa		4.27	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	MRS1	P07266	363 aa		4.27	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	YCR001W	P25347	104 aa		4.27	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	VMA22	P38784	181 aa		4.27	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	DIE2	P50076	525 aa		4.27	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.27	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	COX9	P07255	59 aa		4.26	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.26	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	YBL010C	P32788	280 aa		4.26	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	YHR125W	P38831	101 aa		4.26	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	SRP14	P38985	146 aa		4.26	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	PAM16	P42949	149 aa		4.26	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	YGR050C	P53231	118 aa		4.26	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	YOR268C	Q08734	132 aa		4.26	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	UBC8	P28263	218 aa		4.25	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	BOL1	Q3E793	110 aa		4.25	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.25	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	Q0255	P03881	472 aa		4.24	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.24	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.23	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	SNX4	P47057	423 aa		4.23	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	YGR026W	P53217	278 aa		4.23	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	PAU12	P53343	120 aa		4.23	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	YKR032W	P36127	104 aa		4.22	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
AVO2	YMR068W	PUT1	P09368	476 aa		4.21	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	YGR025W	P53216	100 aa		4.21	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	PLP1	Q04004	230 aa		4.21	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.21	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	FMT1	P32785	401 aa		4.2	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	PAU24	P38155	120 aa		4.2	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	FCY21	P40039	528 aa		4.2	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	POR2	P40478	281 aa		4.2	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	YNL184C	P53876	108 aa		4.2	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	FEX1	Q08913	375 aa		4.2	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	FEX2	Q08991	375 aa		4.2	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.2	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	MRPS8	Q03799	155 aa		4.19	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.19	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	YLR156W	P0CE96	114 aa		4.18	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	YLR159W	P0CE97	114 aa		4.18	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	YLR161W	P0CE98	114 aa		4.18	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	GLE2	P40066	365 aa		4.18	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	UBC12	P52491	188 aa		4.18	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	PRM7	Q12459	698 aa		4.18	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.18	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		4.17	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	JAC1	P53193	184 aa		4.17	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	CNB1	P25296	175 aa		4.16	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	SFK1	P35735	353 aa		4.16	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	YBR242W	P38331	238 aa		4.16	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	GRX5	Q02784	150 aa		4.16	□□□□□ -1.74
AVO2	YMR068W	QCR2	P07257	368 aa		4.15	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	KRE1	P17260	313 aa		4.15	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	BET1	P22804	142 aa		4.15	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	PAU2	P32612	120 aa		4.15	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	YJR015W	P47090	510 aa		4.15	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	RAD28	Q12021	506 aa		4.15	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		4.15	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	PET54	P10834	293 aa		4.14	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	YKR041W	P36134	250 aa		4.14	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	YGL088W	P53151	121 aa		4.14	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	YDL012C	Q12489	107 aa		4.14	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.14	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.14	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	MED11	Q99278	115 aa		4.14	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	SNF11	P38956	169 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	GPI2	P46961	280 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	SEN2	P16658	377 aa		4.12	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	SCM4	P32564	187 aa		4.12	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	AME1	P38313	324 aa		4.12	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	YER076C	P40049	302 aa		4.12	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	YER135C	P40082	130 aa		4.12	□□□□□ -1.75
AVO2	YMR068W	HRD1	Q08109	551 aa		4.12	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 45.2 ms